本公开涉及用于与例如核酸引导的核酸酶一起使用以对靶核酸序列进行修饰的脱氨酶。
背景技术:
1、核酸序列的靶向编辑,例如对基因组dna的靶向切割或靶向修饰,是研究基因功能的有效方法,也有潜力为人类遗传疾病提供新的治疗方法。目前可用的碱基编辑器包括将靶c·g碱基对转变为t·a碱基对的胞苷碱基编辑器(例如be4),和将a·t碱基对转变为g·c碱基对的腺苷碱基编辑器(例如abe7.10)。本领域需要能够以更高的特异性和效率在靶序列内诱导修饰的改进的碱基编辑器。
技术实现思路
1、在第一个方面,本公开记载一种腺苷脱氨酶,其包含与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140和220-240、242中的任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%相同的氨基酸序列。在一些实施方案中,腺苷脱氨酶能够使dna中的腺苷脱氨。在一些实施方案中,腺苷脱氨酶能够使dna中的胞嘧啶脱氨。
2、在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:74编号的s15x、l19x、n30x、a61x、g63x、m81n、v119x、s122x、s153x、s155x、c159x、e164x、e167x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:74编号的s15g、l19a、n30r、a61c、g63q、m81n、v119m、s122r、s153r、s155r、c159r、e164v、e164l、e164w、e167w的位置处的一个或多个改变。
3、在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:82编号的v104x、e107x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:82编号的v104m、e107y、e107k的位置处的一个或多个改变。
4、在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:241编号的g64x、l67x、n69x、y70x、l73x、f81x、h93x、a119x、s139x、c143x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。在一些实施方案中,所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:241编号的g64y、l67y、n69a、y70a,y70g、l73f、f81l、h93v、a119h、s139k、c143a的位置处的一个或多个改变。
5、在另一个方面,本公开记载一种核碱基编辑器,包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶的氨基酸序列与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同。在一些实施方案中,核碱基编辑器还包含一个或多个尿嘧啶糖基化酶抑制剂(ugi)结构域。在一些实施方案中,所述核碱基编辑器为腺苷碱基编辑器(abe)。在一些实施方案中,所述核碱基编辑器为胞苷碱基编辑器(cbe)。在一些实施方案中,所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含选自由cas9结构域、cas12结构域、tnpb结构域、iscb结构域、归巢核酸内切酶(meganuclease)结构域、锌指dna结合结构域和转录激活因子样效应子(tale)dna结合结构域组成的组的结构域。在一些实施方案中,所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含cas9结构域。在一些实施方案中,cas9结构域为金黄色葡萄球菌cas9(sacas9)、嗜热链球菌l cas9(st1cas9)、酿脓链球菌cas9(spcas9)或其变体。在一些实施方案中,所述多核苷酸可编程dna结合结构域为无活性核酸酶或切口酶变体。
6、在一些实施方案中,所述碱基编辑器包含核酸引导的核酸酶蛋白和嵌入式核苷酸碱基编辑器(nbe)结构域。在一些实施方案中,所述嵌入式nbe结构域为腺苷碱基编辑器(abe)结构域。在一些实施方案中,嵌入式abe结构域是嵌入式腺苷脱氨酶蛋白结构域。在一些实施方案中,所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含侧接至少一个嵌入式结构域蛋白的接头。
7、在另一个方面,本公开记载一种编码腺苷脱氨酶的多核苷酸,所述腺苷脱氨酶与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同。
8、在另一个方面,本公开记载一种包含编码腺苷脱氨酶的多核苷酸的表达载体,所述腺苷脱氨酶与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同。在一些实施方案中,所述表达载体是选自由腺相关病毒(aav)、逆转录病毒载体、腺病毒载体、慢病毒载体、仙台病毒载体和疱疹病毒载体组成的组的病毒载体。
9、在另一个方面,本公开记载一种编码核碱基编辑器的多核苷酸,所述核碱基编辑器包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列。
10、在另一个方面,本公开记载一种包含编码核碱基编辑器的多核苷酸的表达载体,所述核碱基编辑器包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述载体是选自由腺相关病毒(aav)、逆转录病毒载体、腺病毒载体、慢病毒载体、仙台病毒载体和疱疹病毒载体组成的组的病毒载体。
11、在另一个方面,本公开记载一种碱基编辑方法,包括将多核苷酸序列与核碱基编辑器接触,所述核碱基编辑器包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列,其中所述腺苷脱氨酶使所述多核苷酸中的核碱基脱氨,从而编辑所述多核苷酸序列。
12、在另一个方面,本公开提供了一种纠正受试者遗传缺陷的方法,所述方法包括向所述受试者施用核碱基编辑器,所述核碱基编辑器包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列,以将所述受试者的靶核苷酸序列中的靶核碱基脱氨,从而纠正所述遗传缺陷。
13、在另一个方面,本公开提供了一种纠正受试者遗传缺陷的方法,所述方法包括向所述受试者施用编码核碱基编辑器的多核苷酸,所述核碱基编辑器包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列,以将所述受试者的靶核苷酸序列中的靶核碱基脱氨,从而纠正所述遗传缺陷。
14、在一些实施方案中,所述方法包括将所述核碱基编辑器或编码所述核碱基编辑器的多核苷酸、以及一个或多个向导多核苷酸递送至所述受试者的细胞。在一些实施方案中,所述受试者是哺乳动物或人类。在一些实施方案中,对所述靶核碱基的脱氨使所述靶核碱基被野生型核碱基替代。
15、除非另有定义,本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。本文描述了用于本发明的方法和材料;也可以使用本领域已知的其他合适的方法和材料。材料、方法和示例仅是说明性的,并不旨在限制。本文提及的所有出版物、专利申请、专利、序列、数据库条目和其他参考文献均以引用的方式全文并入。如有冲突,则以本说明书(包括定义)为准。
16、本发明的其他特征和优点将从以下详细描述和附图以及权利要求书中显而易见。
1.一种腺苷脱氨酶,所述腺苷脱氨酶包含与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%相同的氨基酸序列。
2.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:74编号的s15x、l19x、n30x、a61x、g63x、m81n、v119x、s122x、s153x、s155x、c159x、e164x、e167x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。
3.根据权利要求2所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:74编号的s15g、l19a、n30r、a61c、g63q、m81n、v119m、s122r、s153r、s155r、c159r、e164v、e164l、e164w、e167w的位置处的一个或多个改变。
4.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:82编号的v104x、e107x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。
5.根据权利要求4所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:82编号的v104m、e107y、e107k的位置处的一个或多个改变。
6.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:241编号的g64x、l67x、n69x、y70x、l73x、f81x、h93x、a119x、s139x、c143x的位置处的一个或多个改变,或一个或多个其相应改变,其中x是任意氨基酸。
7.根据权利要求6所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含在相对于seq id no:241编号的g64y、l67y、n69a、y70a,y70g、l73f、f81l、h93v、a119h、s139k、c143a的位置处的一个或多个改变。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶能够对dna中的腺苷脱氨基。
9.根据权利要求1-7中任一项所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶能够对dna中的胞苷脱氨基。
10.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:1编号的w45r、h58l、p70a、l106f、a128v、d130n、h145y、s168c、r174p、e177v、i178f和k179n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
11.根据权利要求10所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:36的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
12.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:4编号的w36r、p61a、r64l、l97f、a119v、d121n、h136y、s159c、d160y、r165p和k170n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
13.根据权利要求12所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:39的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
14.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:5编号的w23r、p48a、r51l、l84f、a106v、d108n、h123y、s146c、d147y、r152p、e155v和k157n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
15.根据权利要求14所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:40的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
16.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:6编号的w23r、p48a、r51l、l84f、a106v、d108n、h123y、s146c、r152p、e155v、和k157n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
17.根据权利要求16所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:41的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
18.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:7编号的w22r、p47a、r50l、l83f、a105v、d107n、h122y、s145c、d146y、r151p和k156n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
19.根据权利要求18所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:42的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
20.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:8编号的w23r、l84f、a106v、d108n、h123y、s146c、d147y、r152p、e155v和k157n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
21.根据权利要求20所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:43的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
22.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:9编号的w21r、p46a、r49l、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
23.根据权利要求22所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:44的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
24.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:10编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
25.根据权利要求24所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:45的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
26.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:11编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
27.根据权利要求26所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:46的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
28.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:12编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
29.根据权利要求28所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:47的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
30.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:14编号的w28r、p53a、l89f、a111v、d113n、h128y、s151c、d152y、r157p和k162n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
31.根据权利要求30所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:49的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
32.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:15编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
33.根据权利要求32所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:50的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
34.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:16编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
35.根据权利要求35所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:51的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
36.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:17编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、h121y、s144c、d145y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
37.根据权利要求37所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:52的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
38.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:24编号的l125f、a147v、d149n、h164y、s187c、r193p、e196v和k198n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
39.根据权利要求38所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:59的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
40.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:1编号的w45r、h58l、p70a、l106f、a128v、d130n、a131s、t133r、d141n、h144n、h145y、s168c、f171y、r174p、e177v、i178f、k179n、t188i和d189n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
41.根据权利要求40所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:71的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
42.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:4编号的w36r、p61a、r64l、l97f、a119v、d121n、a122s、t124r、d132n、h135n、h136y、s159c、f162y、r165p、k170n和d183n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
43.根据权利要求42所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:74的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
44.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:5编号的w23r、p48a、r51l、l84f、a106v、d108n、a109s、t111r、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v、k157n和d166n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
45.根据权利要求44所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:75的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
46.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:6编号的w23r、p48a、r51l、l84f、a106v、d108n、a109s、t111r、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v、k157n和d166n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
47.根据权利要求46所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:76的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
48.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:7编号的w22r、p47a、r50l、l83f、a105v、d107n、a108s、t110r、d118n、h122y、s145c、f148y、r151p和k156n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
49.根据权利要求48所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:77的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
50.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:8编号的w23r、l84f、a106v、d108n、a109s、t111r、d119n、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v和k157n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
51.根据权利要求50所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:78的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
52.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:9编号的w21r、p46a、r49l、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、k155n和d165n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
53.根据权利要求52所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:79的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
54.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:10编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
55.根据权利要求54所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:80的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
56.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:11编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v、k155n和d165n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
57.根据权利要求56所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:81的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
58.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:12编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
59.根据权利要求58所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:82的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
60.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:14编号的w28r、p53a、l89f、a111v、d113n、t116r、d124n、h128y、s151c、f154y、r157p和k162n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
61.根据权利要求60所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:84的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
62.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:15编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、k155n和t163i组成的组的一个或多个氨基酸取代。
63.根据权利要求62所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:85的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
64.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:16编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
65.根据权利要求64所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:86的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
66.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:17编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
67.根据权利要求66所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:87的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
68.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:24编号的l125f、a147v、d149n、t152r、h164y、s187c、f190y、r193p、e196v、k198n和t210i组成的组的一个或多个氨基酸取代。
69.根据权利要求68所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:94的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
70.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:25编号的w23r、p48a、l84f、a106v、d108n、t111r、d119n、h123y、s146c、f149y、r152p、k157n和d169n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
71.根据权利要求70所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:116的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
72.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:26编号的w23r、p48a、l84f、a106v、d108n、t111r、d119n、h123y、s146c、f149y、r152p、k157n和d169n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
73.根据权利要求72所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:117的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
74.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:27编号的w22r、p47a、l83f、a105v、d107n、t110r、d118n、h122y、s145c、f148y、r151p、e154v和k156n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
75.根据权利要求74所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:118的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
76.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:28编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
77.根据权利要求76所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:119的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
78.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:29编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
79.根据权利要求78所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:120的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
80.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:30编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
81.根据权利要求80所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:121的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
82.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:31编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
83.根据权利要求82所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:122的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
84.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:1编号的w45r、h58l、p70a、l106f、a128v、d130q、a131s、t133r、d141n、h144n、h145y、s168c、f171y、r174p、e177v、i178f、k179n、t188i和d189n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
85.根据权利要求84所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:123的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
86.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:4编号的w36r、p61a、r64l、l97f、a119v、d121q、a122s、t124r、d132n、h135n、h136y、s159c、f162y、r165p、k170n和d183n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
87.根据权利要求86所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:124的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
88.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:1编号的w45r、e49a、v50a、h58l、p70a、m83i、l106f、h118n、a128v、d130n、a131s、t133r、d141n、h144n、h145y、s168c、f171y、r174p、e177v、i178f、k179n、t188i和d189n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
89.根据权利要求88所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:125的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
90.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:1编号的w45r、r48g、e49a、v50g、h58l、p70a、l98f、l106f、h118n、a128v、d130n、a131s、t133r、d141n、h144n、h145y、s168c、f171y、r174p、e177v、i178f、k179n、a180s、t188i和d189n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
91.根据权利要求90所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:126的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
92.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:4编号的w36r、e40a、v41a、p61a、r64l、m74i、l97f、h109n、a119v、d121n、a122s、t124r、d132n、h135n、h136y、s159c、f162y、r165p、k170n和d183n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
93.根据权利要求92所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:127的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
94.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:4编号的w36r、e40a、v41g、p61a、r64l、i89f、l97f、h109n、a119v、d121n、a122s、t124r、d132n、h135n、h136y、s159c、f162y、r165p、k170n、a171s和d183n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
95.根据权利要求94所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:128的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
96.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:5编号的w23r、e27a、v28a、p48a、r51l、m61i、l84f、h96n、a106v、d108n、a109s、t111r、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v、k157n和d166n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
97.根据权利要求96所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:129的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
98.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seq idno:5编号的w23r、e27a、v28g、p48a、r51l、l76f、l84f、h96n、a106v、d108n、a109s、t111r、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v、k157n、a158s和d166n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
99.根据权利要求98所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:130的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
100.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:8编号的w23r、e27a、v28a、m61i、l84f、h96n、a106v、d108n、a109s、t111r、d119n、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v和k157n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
101.根据权利要求100所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:131的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
102.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:8编号的w23r、e27a、v28g、l76f、l84f、h96n、a106v、d108n、a109s、t111r、d119n、h123y、s146c、f149y、r152p、e155v、k157n和a158s组成的组的一个或多个氨基酸取代。
103.根据权利要求102所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:132的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
104.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:9编号的w21r、e25a、v26a、p46a、r49l、m59i、l82f、h94n、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、k155n和d165n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
105.根据权利要求104所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:133的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
106.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:9编号的w21r、e25a、v26g、p46a、r49l、l74f、l82f、h94n、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、k155n、a156s和d165n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
107.根据权利要求106所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:134的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
108.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:10编号的w21r、e25a、v26a、h34l、p46a、m59i、l82f、h94n、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
109.根据权利要求108所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:135的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
110.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:10编号的w21r、e25a、v26g、h34l、p46a、l74f、l82f、h94n、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v、k155n和a156s组成的组的一个或多个氨基酸取代。
111.根据权利要求110所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:136的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
112.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:12编号的w21r、e25a、v26a、h34l、p46a、m59i、l82f、h94n、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
113.根据权利要求112所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:137的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
114.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:12编号的w21r、e25a、v26g、h34l、p46a、l74f、l82f、h94n、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v、k155n和a156s组成的组的一个或多个氨基酸取代。
115.根据权利要求114所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:138的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
116.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:24编号的e68a、v69a、l125f、h137n、a147v、d149n、t152r、h164y、s187c、f190y、r193p、e196v、k198n和t210i组成的组的一个或多个氨基酸取代。
117.根据权利要求116所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:139的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
118.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:24编号的e68a、v69g、l117f、l125f、h137n、a147v、d149n、t152r、h164y、s187c、f190y、r193p、e196v、k198n、a199s和t210i组成的组的一个或多个氨基酸取代。
119.根据权利要求118所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:140的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
120.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:202编号的l120f、a142v、d144n、t147r、h159y、s182c、f185y、r188p、e191v和k193n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
121.根据权利要求120所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:220的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
122.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:203编号的l121f、a143v、d145n、t148r、h160y、s183c、f186y、r189p、e192v和k194n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
123.根据权利要求122所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:221的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
124.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:205编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
125.根据权利要求124所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:222的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
126.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:206编号的l79f、a101v、d103n、t106r、h118y、s141c、f144y、r147p、e150v、k152n和d162n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
127.根据权利要求126所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:223的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
128.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:209编号的w41r、p66a、l102f、a124v、d126n、a127s、t129r、d137n、h141y、s164c、f167y、r170p、e173v和k175n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
129.根据权利要求128所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:224的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
130.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:210编号的p52a、l88f、a110v、d112n、t115r、d123n、h127y、s150c、f153y、r156p和k161n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
131.根据权利要求130所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:225的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
132.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:211编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、k155n和d165n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
133.根据权利要求132所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:226的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
134.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:212编号的p57a、l93f、a115v、d117n、t120r、d128n、h132y、s155c、f158y和r161p组成的组的一个或多个氨基酸取代。
135.根据权利要求134所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:227的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
136.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:215编号的w22r、p47a、l83f、a105v、d107n、a108s、t110r、d118n、h122y、s145c、f148y、r151p和k156n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
137.根据权利要求136所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:228的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
138.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:216编号的w22r、l83f、a105v、d107n、a108s、t110r、d118n、h122y、s145c、f148y、r151p、e154v和k156n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
139.根据权利要求138所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:229的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
140.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:217编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p、e153v和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
141.根据权利要求140所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:230的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
142.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:218编号的w21r、p46a、l82f、a104v、d106n、a107s、t109r、d117n、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
143.根据权利要求142所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:231的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
144.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:219编号的w21r、h34l、p46a、l82f、a104v、d106n、t109r、h121y、s144c、f147y、r150p和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
145.根据权利要求144所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:232的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
146.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:200编号的w20r、p45a、l81f、d105n、s143c、d144r、r149p、e151r和k154n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
147.根据权利要求146所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:233的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
148.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:201编号的p83a、l119f、f139v、d143n、s181c、d182r、r187p、k189r、e190v、i191f和k192n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
149.根据权利要求148所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:234的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
150.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:24编号的l125f、f145v、d149n、s187c、r193p、e195r、e196v和k198n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
151.根据权利要求150所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:235的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
152.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:204编号的l121f、f141v、d145n、s183c、r189p、e191r、e192v和k194n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
153.根据权利要求152所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:236的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
154.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:205编号的w21r、p46a、l82f、d106n、s144c、d145r、r150p、e152r和k155n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
155.根据权利要求154所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:237的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
156.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:206编号的l79f、f99v、d103n、s141c、g142r、r147p、a149r、e150v和k152n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
157.根据权利要求156所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:238的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
158.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:207编号的p46a、l82f、d106n、s144c、a145r、r150p、q152r、e153v和k158n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
159.根据权利要求158所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:239的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
160.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:208编号的w20r、p45a、l81f、d105n、s143c、d144r、r149p、e151r、e152v和k154n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
161.根据权利要求160所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:240的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
162.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:213编号的l81f、d105n、t120h、s143c、d144r、r149p、a151r、e152v和k154n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
163.根据权利要求162所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:241的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
164.根据权利要求1所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶包含选自由相对于seqid no:214编号的p83a、l119f、f139v、d143n、s181c、d182r、r187p、k189r、e190v、i191f和k192n组成的组的一个或多个氨基酸取代。
165.根据权利要求164所述的腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶是具有seq id no:242的氨基酸序列的腺苷脱氨酶。
166.一种核碱基编辑器,包含:(i)多核苷酸可编程dna结合结构域;和(ii)腺苷脱氨酶,其中所述腺苷脱氨酶具有与seq id no:74、82、241、268-270、36、39-47、49-52、59、71、75-81、84-87、94、116-140、和220-240、242中任一个至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同的氨基酸序列。
167.根据权利要求166所述的核碱基编辑器,还包含一个或多个尿嘧啶糖基化酶抑制剂(ugi)结构域。
168.根据权利要求166或167所述的核碱基编辑器,其中所述核碱基编辑器为腺苷碱基编辑器(abe)。
169.根据权利要求166或167所述的核碱基编辑器,其中所述核碱基编辑器为胞苷碱基编辑器(cbe)。
170.根据权利要求166-169任一项所述的核碱基编辑器,其中所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含选自由cas9结构域、cas12结构域、tnpb结构域、iscb结构域、归巢核酸内切酶结构域、锌指dna结合结构域和转录激活因子样效应子(tale)dna结合结构域组成的组的结构域。
171.根据权利要求170所述的核碱基编辑器,其中所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含cas9结构域。
172.根据权利要求171所述的核碱基编辑器,其中所述cas9结构域为金黄色葡萄球菌cas9(sacas9)、嗜热链球菌lcas9(st1cas9)、酿脓链球菌cas9(spcas9)或其变体。
173.根据权利要求166-172中任一项所述的核碱基编辑器,其中所述多核苷酸可编程dna结合结构域为无活性核酸酶或切口酶变体。
174.根据权利要求166-173中任一项所述的核碱基编辑器,其中所述碱基编辑器包含核酸引导的核酸酶蛋白和嵌入式核苷酸碱基编辑器(nbe)结构域。
175.根据权利要求174所述的核碱基编辑器,其中所述嵌入式nbe结构域为腺苷碱基编辑器(abe)结构域。
176.根据权利要求175所述的核碱基编辑器,其中所述嵌入式abe结构域是嵌入式腺苷脱氨酶蛋白结构域。
177.根据权利要求176所述的核碱基编辑器,其中所述多核苷酸可编程dna结合结构域包含侧接至少一个嵌入式结构域蛋白的接头。
178.一种编码根据权利要求1-165中任一项所述的腺苷脱氨酶的多核苷酸。
179.一种包含根据权利要求178所述的多核苷酸的表达载体。
180.根据权利要求179所述的表达载体,其中所述载体是选自由腺相关病毒(aav)、逆转录病毒载体、腺病毒载体、慢病毒载体、仙台病毒载体和疱疹病毒载体组成的组的病毒载体。
181.一种编码根据权利要求166-177中任一项所述的核碱基编辑器的多核苷酸。
182.一种包含根据权利要求181所述的多核苷酸的表达载体。
183.根据权利要求182所述的表达载体,其中所述载体是选自由腺相关病毒(aav)、逆转录病毒载体、腺病毒载体、慢病毒载体、仙台病毒载体和疱疹病毒载体组成的组的病毒载体。
184.一种包含根据权利要求179或180或182或183所述的表达载体的细胞。
185.一种碱基编辑方法,包括将多核苷酸序列与根据权利要求166-177中任一项所述的核碱基编辑器接触,其中所述腺苷脱氨酶使所述多核苷酸中的核碱基脱氨,从而编辑所述多核苷酸序列。
186.一种纠正受试者遗传缺陷的方法,所述方法包括向所述受试者施用:根据权利要求166-177中任一项所述的核碱基编辑器或编码根据权利要求166-177中任一项所述的核碱基编辑器的多核苷酸,以及指导所述核碱基编辑器将所述受试者的靶核苷酸序列中的靶核碱基脱氨的一个或多个向导多核苷酸,从而纠正所述遗传缺陷。
187.根据权利要求186所述的方法,包括将所述核碱基编辑器或编码所述核碱基编辑器的多核苷酸、以及一个或多个向导多核苷酸递送至所述受试者的细胞。
188.权利要求所述的方法,其中所述受试者是哺乳动物或人类。
189.根据权利要求185-188中任一项所述的方法,其中对所述靶核碱基的脱氨使所述靶核碱基被野生型核碱基替代。