本发明属于生物医药,尤其涉及一种肠道菌株escherichia colibw25113的应用。
背景技术:
1、iga肾病(iganephropathy,igan)是我国最常见的慢性肾脏病(chronic kidneydisease,ckd)之一,其发病率较高,预后较差,给临床防治带来了重大挑战。其确切的发病机制尚未完全阐明,目前认为异常增多的半乳糖缺乏的iga1(galactose-deficient iga1,gd-iga1)及其形成的致病性免疫复合物沉积在肾小球是igan发生的关键。然而,gd-iga1的来源尚不清楚,因此,缺乏针对病因的关键治疗策略。新近研究发现,gd-iga1可能主要来源于肠道黏膜免疫系统,肠道菌群紊乱在其中发挥关键作用。然而,具体是哪种肠道菌群通过何种机制介导肠道黏膜免疫产生gd-iga1,尚不清楚。
2、我们前期研究发现:变形菌门-γ-变形菌纲-肠杆菌目-肠杆菌科-大肠杆菌-志贺氏菌属(‘proteobacteria_gammaproteobacteria_enterobacteriales_enterobacteriaceae
3、_escherichia-shigella’)菌群链在igan患者肠道内过度增殖,其中escherichia-shigella是丰度激增的主要贡献者,且其丰度降低与igan临床缓解密切相关(jam socnephrol.2022;33(12):2276-2292.)。同时,我们通过粪菌移植(fecalmicrobiotatransplantation,fmt)重建肠道菌群稳态,显著降低难治性igan患者尿蛋白水平,且维持肾功能稳定,尤其escherichia-shigella的丰度在治疗后大幅降低。上述结果提示,escherichia-shigella可能是影响igan发生和临床疗效的关键菌群。
技术实现思路
1、针对上述发现,本发明对igan患者肠道菌群进一步进行宏基因测序,并对患者粪标本进行细菌分离、培养及鉴定,发现escherichia coli bw25113(e.coli bw25113)是escherichia-shigella菌属丰度贡献的主要菌株;而且将e.coli bw25113定植于正常sd大鼠后,出现肾功能损伤和肾脏病理损害,肾小球系膜区iga沉积,外周血iga+b220+b细胞增多;将其定植于igan大鼠模型,肾损伤表型加重,而使用抗生素可减轻上述改变。因此,提出肠道e.coli bw25113菌株可作为iga肾病进展的分子标志物及独立的生存预后因子。为iga肾病治疗提供新的诊断、治疗及预后预测靶点。
2、本发明的目的是提供一种肠道菌株escherichia coli bw25113的应用,包括肠道菌株escherichia coli bw25113作为靶点在制备治疗iga肾病的药物中的应用。
3、其次,本发明提供的肠道菌株escherichia coli bw25113可作为标志物在制备诊断或辅助诊断iga肾病检测工具中的应用;
4、和/或肠道菌株escherichia coli bw25113作为标志物在制备预后评估iga肾病检测工具中的应用;
5、和/或肠道菌株escherichia coli bw25113作为干预因素,在构造iga肾病动物模型中的应用;
6、和/或肠道菌株escherichia coli bw25113作为标志物在制备监测iga肾病进展检测工具中的应用。
7、作为本技术方案优选地,检测工具的检测对象为从受试者采集的待测样品,待测样品为粪便或肠道内容物。
8、作为本技术方案优选地,检测工具包括用于检测待测样品中escherichia colibw25113菌株相对丰度的产品。
9、其中,在对escherichia coli bw25113菌株的相对丰度进行测试时,先使用宏基因测序发现了escherichia coli bw25113菌株,通过细菌分离培养鉴定及blast进行比对验证。
10、作为本技术方案优选地,检测工具还包括记载有如下判断标准的载体:待测样品中escherichia coli bw25113菌株含量越高,发生iga肾病的风险越高。
11、上述检测工具包括但不限于试剂盒、芯片、药物、引物或探针等。
12、作为本技术方案优选地,在对待测样品中escherichia coli bw25113菌株丰度进行测试时,首先需要使用试剂盒对样品中的细菌dna进行提取,因此,所述检测工具还包括对待测样品dna进行提取和对escherichia coli bw25113菌株丰度进行测定所需的试剂,包括探针、引物、缓冲液、酶或流动相等。
13、另外,本发明escherichia coli bw25113菌株还可以应用于药物筛选,基于此,本发明提出了一种iga肾病药物筛选方法,也即escherichia coli bw25113菌株在iga肾病预防或治疗药物筛选中的应用。
14、具体地,药物筛选包括通过判定药物对escherichia coli bw25113菌株的靶向抑制程度,确定药物是否入选。这里的药物为治疗iga肾病的药物。
15、与现有技术相比,本发明具有如下优点:
16、本发明通过对iga肾病患者肠道菌株特异性筛选,首次发现了引发iga肾病发生的关键肠道菌株escherichia coli bw25113,将escherichia coli bw25113菌株作为标志物,用于制备诊断或辅助诊断iga肾病检测工具,通过该检测工具来检测待测样品中escherichia coli bw25113菌株的相对丰度,可以独立或辅助判断是否患有iga肾病、监测个体在疾病发展中的过程、临床预后评估等。为iga肾病诊断及早期预防提供了有效且可靠的手段,不仅有利于iga肾病的诊断与分型,而且为未来iga肾病的治疗与防治提供了新靶点。
1.肠道菌株escherichia coli bw25113的应用,其特征在于,包括肠道菌株escherichia coli bw25113作为靶点在制备治疗iga肾病的药物中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,还包括:
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,检测工具包括用于检测待测样品中escherichia coli bw25113菌株相对丰度的产品。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,检测工具的检测对象为从受试者采集的待测样品,待测样品为粪便或肠道内容物。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,检测工具还包括对待测样品dna进行提取和对escherichia coli bw25113菌株丰度进行测定所需的试剂。
6.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,还包括escherichia coli bw25113菌株在iga肾病预防或治疗药物筛选中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,药物筛选包括通过判定药物对escherichia coli bw25113菌株的靶向抑制程度,确定药物是否入选。