一种天然产物芍药苷光亲和探针及其合成方法和应用与流程

allin2025-06-01  108


本申请涉及药物合成领域,主要涉及一种天然产物芍药苷光亲和探针及其合成方法和应用。


背景技术:

1、芍药苷(paeoniflorin,pf),是中药白芍和赤芍的主要成分,在自然界中广泛存在,具有抗炎、降血糖、保护神经、免疫调节等多种生物活性。近年来,因其对多种肿瘤细胞表现出较好的抗增殖活性而被广泛关注。对于肝癌细胞,体外研究表明,芍药苷可能是通过抑制核因子κb(nf-jb)通路或者hedgehog/gli通路异常激活从而抑制肿瘤细胞异常增殖,对于肺癌细胞,芍药苷则可能是通过凋亡fas/fasl系统来实现对肿瘤细胞异常增殖的抑制。基于活性的蛋白质谱分析技术(abpp)广泛用于发现天然产物、细胞内代谢物及新合成药物等小分子的作用靶点领域。对于非共价化合物而言,首先将其设计成能与靶标蛋白产生亲和作用的活性小分子探针,其在特定波长照射下可分解成高活性的中间体,从而与受体活性部位形成特异的不可逆共价结合。

2、对于芍药苷对肿瘤细胞的作用靶点研究不足的原因在于芍药苷等天然产物生物活性往往是多靶点作用的并且芍药苷与靶蛋白之间多为非共价的弱相互作用。在活细胞水平鉴定芍药苷的作用靶点,有助于发掘新的癌症疾病治疗靶标,为药物开发提供更多机会。


技术实现思路

1、为了解决无法精确找到芍药苷对肿瘤细胞的直接作用靶点的问题,本申请提供了一种天然产物芍药苷光亲和探针及其合成方法和应用。

2、本申请公开了一种天然产物芍药苷光亲和探针的结构式如下:

3、

4、本申请还公开了一种天然产物芍药苷光亲和探针的合成方法,所述天然产物芍药苷光亲和探针以芍药苷母核为活性基团,在芍药苷母核醇羟基处引入光交联基团和生物正交基团,其中双吖丙啶光为交联基团,该基团在紫外光照的条件下,能够原位交联临近的结合蛋白质。

5、可选的,所述天然产物芍药苷光亲和探针炔基为生物正交基团,通过生物正交偶联反应和荧光素或生物素偶联,能对探针标记信号进行检测。

6、可选的,所述天然产物芍药苷光亲和探针化合物i的合成方法包括:

7、

8、通过化合物ⅱ与2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物和三氯异氰尿酸反应得到化合物ⅲ,化合物ⅲ再与化合物ⅳ反应得到探针化合物ⅰ,所述探针化合物ⅰ即为所述天然产物芍药苷光亲和探针。

9、可选的,所述天然产物芍药苷光亲和探针合成方法,具体包括:

10、将化合物ⅱ加入n,n-二甲基甲酰胺中,在0-5℃下,搅拌,加入碱,接着加入2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物和三氯异氰尿酸,加入完成后,0-5℃下搅拌5-10小时,然后加入10%亚硫酸钠水溶液淬灭反应,搅拌后,冻干机上冷冻干燥,向冻干后的残留物中加入n,n-二甲基甲酰胺,搅拌,过滤,滤饼用n,n-二甲基甲酰胺淋洗,合并滤液,得到化合物ⅲ的n,n-二甲基甲酰胺溶液;

11、将所述化合物ⅲ的n,n-二甲基甲酰胺溶液用冰水浴冷却,加入化合物ⅳ,在0-5℃下搅拌1小时,然后加入nabh3cn,冰水浴下搅拌2-5小时,纯化后得到探针化合物ⅰ。

12、可选的,所述天然产物芍药苷光亲和探针合成方法,具体包括:

13、所述化合物ⅱ与所述2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物的摩尔比为1:0.15~0.25,所述化合物ⅱ与所述三氯异氰尿酸的摩尔比为1:0.70~0.80;所述化合物ⅳ与所述nabh3cn的摩尔比为1:1.70~1.80。

14、可选的,所述碱为碳酸钠、碳酸钾、碳酸氢钠或者碳酸氢钾。

15、本申请提供了所述天然产物芍药苷光亲和探针化合物i在确定芍药苷对肿瘤细胞的直接作用靶点中的应用。

16、可选的,所述天然产物芍药苷光亲和探针化合物i在确定芍药苷对肿瘤细胞的直接作用靶点中的应用,具体包括:

17、应用天然产物芍药苷光亲和探针化合物i在肿瘤细胞中鉴定到潜在芍药苷的结合蛋白质,通过对蛋白质质谱数据分析,确定高置信度靶点蛋白质。

18、本申请提供了一种天然产物芍药苷光亲和探针的结构式,以及所述天然产物芍药苷光亲和探针的合成方法及应用。应用所述天然产物芍药苷光亲和探针在肿瘤细胞中鉴定到潜在芍药苷的结合蛋白质,随后可以通过对蛋白质质谱数据分析,确定高置信度靶点蛋白质。蛋白靶点的确认后,有助于进一步优化芍药苷的结构,提高其特异性和选择性,成为临床前候选药物分子。



技术特征:

1.一种天然产物芍药苷光亲和探针的结构式如下:

2.一种权利要求1所述的天然产物芍药苷光亲和探针化合物i的合成方法,其特征在于,所述天然产物芍药苷光亲和探针以芍药苷母核为活性基团,在芍药苷母核醇羟基处引入光交联基团和生物正交基团,其中双吖丙啶光为交联基团,该基团在紫外光照的条件下,能够原位交联临近的结合蛋白质。

3.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于,所述天然产物芍药苷光亲和探针炔基为生物正交基团,通过生物正交偶联反应和荧光素或生物素偶联,能对探针标记信号进行检测。

4.一种权利要求1所述的天然产物芍药苷光亲和探针化合物i的合成方法,其特征在于,包括:

5.根据权利要求4所述的合成方法,其特征在于,具体包括:

6.根据权利要求4所述的合成方法,其特征在于,具体包括:

7.根据权利要求6所述的合成方法,其特征在于,所述碱为碳酸钠、碳酸钾、碳酸氢钠或者碳酸氢钾。

8.根据权利要求1所述的天然产物芍药苷光亲和探针化合物i在确定芍药苷对肿瘤细胞的直接作用靶点中的应用。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,具体包括:


技术总结
本申请提供了一种天然产物芍药苷光亲和探针的结构式,以及所述的天然产物芍药苷光亲和探针化合物I的合成方法及应用。应用所述天然产物芍药苷光亲和探针在肿瘤细胞中鉴定到潜在芍药苷的结合蛋白质,随后可以通过对蛋白质质谱数据分析,确定高置信度靶点蛋白质。蛋白靶点的确认后,有助于进一步优化芍药苷的结构,提高其特异性和选择性,成为临床前候选药物分子。

技术研发人员:陈南,王清清
受保护的技术使用者:南京科络思生物科技有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/10/31
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