膨腹海马吻宽关联SNP位点的双倍型在育种中的应用

allin2026-02-24  23


本发明涉及膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,属于水产育种。


背景技术:

1、吻宽是海马开口摄食的重要指标。海马幼苗需摄食活体丰年虫,孵化时间需要严格把控。对于吻较窄的海马,无法摄食活体丰年虫会导致死亡,严重影响幼苗成活率和海马养殖产量。

2、目前,人工培育的优良海马养殖品系依然缺乏。研究团队已培育出海马速生品系f3代,在其中筛选出了吻宽显著提高的群体,并定位吻宽关联snp,以期提高海马幼苗成活率及养殖产量。

3、目前,尚无膨腹海马(distended hippocampus)吻宽关联snp位点在育种中的应用,最相似的是线纹海马生长相关微卫星标记。然而,微卫星标记只能通过电泳片段大小对线纹海马进行粗略鉴别,无法精确定位吻宽相关snp,也无法判断具有生长优势的线纹海马是否纯合和可遗传。


技术实现思路

1、为解决现有技术的不足,本发明提供膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,克服开口饵料口径的限制,提高幼苗的成活率,可推动膨腹海马工厂化养殖的发展。

2、为实现上述目标,本发明采用如下技术方案:

3、膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、t,单倍ii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、g,单倍iii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是c、g,igf2r基因的核苷酸序列如seq idno:1或seq id no:2所示,3种单倍型随机形成纯合双倍i型t1061t1061t1198t1198、杂合双倍ii型t1061t1061t1198g1198、纯合双倍iii型t1061t1061g1198g1198、杂合双倍iv型t1061c1061g1198g1198和纯合双倍v型c1061c1061g1198g1198 5种双倍型,纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均吻宽和igf2r基因相对表达方面具有显著优势,纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。

4、本发明的有益之处在于:将膨腹海马类胰岛素生长因子2受体基因(igf2r基因)的2个snp位点(分别位于igf2r基因外显子1061和1198处)与膨腹海马吻宽进行关联分析,发现该2个snp位点与吻宽显著相关,其中,单倍iii型(c1061g1198)个体吻宽显著提高。通过进一步对纯合双倍i型(di)、杂合双倍ii型(dii)、纯合双倍iii型(diii)、杂合双倍iv型(div)、纯合双倍v型(dv)5种双倍型个体进行吻宽和igf2r基因表达对比分析,发现膨腹海马吻宽和igf2r基因的表达在速生品系f3代与普通群体中存在显著差异,其中,纯合双倍v型(dv)膨腹海马的平均吻宽和igf2r基因相对表达量均显著高于其它4种双倍型,纯合双倍v型(dv)可作为吻宽相关的分子标记,应用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种,以提高海马速生良种在幼苗阶段的成活率。



技术特征:

1.膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,其特征在于,所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、t,单倍ii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、g,单倍iii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是c、g,igf2r基因的核苷酸序列如seq id no:1或seq id no:2所示,3种单倍型随机形成纯合双倍i型t1061t1061t1198t1198、杂合双倍ii型t1061t1061t1198g1198、纯合双倍iii型t1061t1061g1198g1198、杂合双倍iv型t1061c1061g1198g1198和纯合双倍v型c1061c1061g1198g1198 5种双倍型,纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均吻宽和igf2r基因相对表达方面具有显著优势,纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。


技术总结
本发明公开了膨腹海马吻宽关联SNP位点的双倍型在育种中的应用,属于水产育种技术领域。所述双倍型由单倍I型、单倍II型、单倍III型随机形成,其中,单倍I型的IGF2R基因外显子1061和1198处的碱基分别是T、T,单倍II型的IGF2R基因外显子1061和1198处的碱基分别是T、G,单倍III型的IGF2R基因外显子1061和1198处的碱基分别是C、G,单倍III型随机形成的纯合双倍V型相比于其它双倍型在平均吻宽和IGF2R基因表达方面具有显著优势,纯合双倍V型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种,加快海马速生良种的选育进程。

技术研发人员:苏晓磊,王凯,贾龙武,张宁,侯玉平,石琳,林强,王信,秦耿
受保护的技术使用者:鲁东大学
技术研发日:
技术公布日:2024/10/31
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