本发明涉及膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,属于水产育种。
背景技术:
1、吻宽是海马开口摄食的重要指标。海马幼苗需摄食活体丰年虫,孵化时间需要严格把控。对于吻较窄的海马,无法摄食活体丰年虫会导致死亡,严重影响幼苗成活率和海马养殖产量。
2、目前,人工培育的优良海马养殖品系依然缺乏。研究团队已培育出海马速生品系f3代,在其中筛选出了吻宽显著提高的群体,并定位吻宽关联snp,以期提高海马幼苗成活率及养殖产量。
3、目前,尚无膨腹海马(distended hippocampus)吻宽关联snp位点在育种中的应用,最相似的是线纹海马生长相关微卫星标记。然而,微卫星标记只能通过电泳片段大小对线纹海马进行粗略鉴别,无法精确定位吻宽相关snp,也无法判断具有生长优势的线纹海马是否纯合和可遗传。
技术实现思路
1、为解决现有技术的不足,本发明提供膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,克服开口饵料口径的限制,提高幼苗的成活率,可推动膨腹海马工厂化养殖的发展。
2、为实现上述目标,本发明采用如下技术方案:
3、膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、t,单倍ii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、g,单倍iii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是c、g,igf2r基因的核苷酸序列如seq idno:1或seq id no:2所示,3种单倍型随机形成纯合双倍i型t1061t1061t1198t1198、杂合双倍ii型t1061t1061t1198g1198、纯合双倍iii型t1061t1061g1198g1198、杂合双倍iv型t1061c1061g1198g1198和纯合双倍v型c1061c1061g1198g1198 5种双倍型,纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均吻宽和igf2r基因相对表达方面具有显著优势,纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
4、本发明的有益之处在于:将膨腹海马类胰岛素生长因子2受体基因(igf2r基因)的2个snp位点(分别位于igf2r基因外显子1061和1198处)与膨腹海马吻宽进行关联分析,发现该2个snp位点与吻宽显著相关,其中,单倍iii型(c1061g1198)个体吻宽显著提高。通过进一步对纯合双倍i型(di)、杂合双倍ii型(dii)、纯合双倍iii型(diii)、杂合双倍iv型(div)、纯合双倍v型(dv)5种双倍型个体进行吻宽和igf2r基因表达对比分析,发现膨腹海马吻宽和igf2r基因的表达在速生品系f3代与普通群体中存在显著差异,其中,纯合双倍v型(dv)膨腹海马的平均吻宽和igf2r基因相对表达量均显著高于其它4种双倍型,纯合双倍v型(dv)可作为吻宽相关的分子标记,应用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种,以提高海马速生良种在幼苗阶段的成活率。
1.膨腹海马吻宽关联snp位点的双倍型在育种中的应用,其特征在于,所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、t,单倍ii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是t、g,单倍iii型的igf2r基因外显子1061处和1198处的碱基分别是c、g,igf2r基因的核苷酸序列如seq id no:1或seq id no:2所示,3种单倍型随机形成纯合双倍i型t1061t1061t1198t1198、杂合双倍ii型t1061t1061t1198g1198、纯合双倍iii型t1061t1061g1198g1198、杂合双倍iv型t1061c1061g1198g1198和纯合双倍v型c1061c1061g1198g1198 5种双倍型,纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均吻宽和igf2r基因相对表达方面具有显著优势,纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
