本发明涉及膨腹海马体长关联snp位点的双倍型在育种中的应用，属于水产育种。
背景技术：
1、体长是评价海马生长性能的重要指标。目前，由于养殖海马无序自交和缺乏种质资源把控，造成海马养殖品种体长显著降低，极大影响了海马的产量。
2、目前，人工培育的优良海马养殖品系依然缺乏。研究团队已培育出海马速生品系f3代，在其中筛选出体长显著提高的群体，并定位体长关联snp，以期提高海马养殖产量。
3、目前，尚无膨腹海马（distended hippocampus）体长关联snp位点在育种中的应用，最相似的是线纹海马生长相关微卫星标记。然而，微卫星标记只能通过电泳片段大小对线纹海马进行粗略鉴别，无法精确定位体长相关snp，也无法判断具有生长优势的线纹海马是否纯合和可遗传。
技术实现思路
1、为解决现有技术的不足，本发明提供膨腹海马体长关联snp位点的双倍型在育种中的应用，克服多种因子的限制，严格调控海马生长过程，可推动膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
2、为实现上述目标，本发明采用如下技术方案：
3、膨腹海马体长关联snp位点的双倍型在育种中的应用，所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成，其中，单倍i型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是t、c，单倍ii型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是t、a，单倍iii型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是a、a，acaca基因的核苷酸序列如seq id no：1或seqid no：2所示，3种单倍型随机形成纯合双倍i型t534t534c601c601、杂合双倍ii型t534t534c601a601、纯合双倍iii型t534t534a601a601、杂合双倍iv型t534a534a601a601和纯合双倍v型a534a534a601a601 5种双倍型，纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均体长和acaca基因相对表达方面具有显著优势，纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
4、本发明的有益之处在于：将乙酰辅酶a羧化酶基因（acaca基因）的2个snp位点（分别位于acaca基因外显子534处和601处）与膨腹海马体长进行关联分析，发现该2个snp位点与体长显著相关，其中，单倍iii型（a534a601）个体体长显著提高。通过进一步对纯合双倍i型（di）、杂合双倍ii型（dii）、纯合双倍iii型（diii）、杂合双倍iv型（div）、纯合双倍v型（dv）5种双倍型个体进行体长对比分析，发现膨腹海马体长和acaca基因的表达在速生品系f3代与普通群体中存在显著差异，其中，纯合双倍v型（dv）膨腹海马的体长和acaca基因相对表达量显著高于其它4种双倍型，双倍v型（dv）可作为体长相关的分子标记，应用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种，以提高海马速生良种在幼苗阶段的成活率。
1.膨腹海马体长关联snp位点的双倍型在育种中的应用，其特征在于，所述双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成，其中，单倍i型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是t、c，单倍ii型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是t、a，单倍iii型的acaca基因外显子534处和601处的碱基分别是a、a，acaca基因的核苷酸序列如seq idno：1或seq id no：2所示，3种单倍型随机形成纯合双倍i型t534t534c601c601、杂合双倍ii型t534t534c601a601、纯合双倍iii型t534t534a601a601、杂合双倍iv型t534a534a601a601和纯合双倍v型a534a534a601a601 5种双倍型，纯合双倍v型相比于其它4种双倍型在平均体长和acaca基因相对表达方面具有显著优势，纯合双倍v型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
