医学数据分析方法和平台、设备、介质与流程

allin2023-03-17  133



1.本技术涉及数据管理技术领域,特别是涉及一种医学数据分析方法和平台、设备、介质。


背景技术:

2.在临床科学研究工作中,往往需要对病例样本的医学数据进行高效的管理和分析等工作。但是目标没有可以用于进行医学数据管理的可视化系统,导致临床科研团队在数据管理方面需要耗费大量的人力物力以及时间,临床科研团队在数据管理上的成本较大。


技术实现要素:

3.本技术至少提供一种医学数据分析方法和平台、设备、介质。
4.本技术提供了一种医学数据分析方法,包括:响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,目标队列包含若干目标对象,目标队列的医学数据包括若干目标对象的生物组学数据;对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果;显示目标队列的医学数据分析结果。
5.因此,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于用户对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
6.其中,对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,包括以下任意一个或多个步骤:响应于在数据分析界面上的第一触发操作,对目标队列中的医学数据进行统计,得到目标队列的队列数据统计情况;响应于在数据分析界面上的第二触发操作,将目标队列与参考队列的医学数据进行对比,得到目标队列的队列对比情况;响应于在数据分析界面上的第三触发操作,利用目标队列的医学数据进行基因统计,得到目标队列的基因图谱,基因图谱用于表征目标队列中的目标对象的基因突变情况;响应于在数据分析界面上的第四触发操作,利用目标队列的医学数据进行生存分析,得到目标队列的生存分析结果。
7.因此,通过根据不同的触发操作,对目标队列的医学数据进行不同的分析,能够提高数据分析的灵活度。
8.其中,至少部分医学数据分析结果采用图表进行显示;和/或,医学数据还包括目标对象的临床数据,临床数据包括目标对象的基本信息和疾病信息,生物组学数据包括目标对象的基因信息和基因检测文件中的至少一种,基因检测文件包含对目标对象的样本进行基因检测得到基因检测结果。
9.因此,通过使用图标进行显示,能够提高分析结果的可读性。通过对目标对象的临床数据进行分析,能够得到目标队列中不同目标对象的临床数据的共性,以便于后续分析。
10.其中,队列数据统计情况包括第一队列情况、对临床数据统计得到的临床统计情况和对生物组学数据统计得到的生物组学统计情况;第一队列情况包括目标队列的名称、
目标队列的对象数量中的至少一者;临床统计情况包括以下至少一者:目标队列中不同性别的比例、目标队列中不同患病年龄区间的比例、目标队列的生存曲线;生物组学统计情况包括若干第一预设基因的对象数量统计情况。
11.因此,通过对第一队列情况进行展示,使得能够直观看到第一队列的整体情况。
12.其中,不同的队列数据统计情况显示在队列情况显示界面的不同区域;方法还包括以下至少一个步骤:响应于对队列情况显示界面的标题编辑触发操作,将队列情况显示界面的第一标题调整为可编辑状态,并基于输入标题信息更新第一标题;响应于在队列情况显示界面上的更新触发操作,重新统计并显示所选择的队列数据统计情况;响应于在队列情况显示界面上的第一下载触发操作,下载所选择的队列数据统计情况;获取在队列情况显示界面的第一搜索区输入的基因名称,从目标队列的医学数据中查找出与输入的基因名称的关联数据,并在队列情况显示界面显示关联数据。
13.因此,可以更改标题、重新统计选择的队列数据统计情况以及下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的关联数据,方便对队列数据以及分析结果进行管理。
14.其中,队列对比情况包括第二队列情况、对临床数据进行比对得到的临床对比情况和对生物组学数据比对得到的生物组学比对情况;第二队列情况包括目标队列和参考队列的名称、目标队列和参考队列的对象数量中的至少一者;临床对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列中不同性别的对象数量差异、目标队列和参考队列中患病年龄的情况差异、目标队列和参考队列的生存曲线;生物组学对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列的基因突变频率对比情况、目标队列和参考队列中突变频率大于预设阈值的突变基因的对比情况、若干第二预设基因在目标队列和参考队列中的突变频率对比情况、目标队列和参考队列中的各基因情况。
15.因此,通过对两个队列的临床数据进行对比以及生物组学数据进行对比,使得能够直观的展示两个队列在多个层面之间的相同点和不同点。
16.其中,显示目标队列的医学数据分析结果,包括:在对比显示界面的第一区域显示第二队列情况;以及,响应于对对比显示界面的第一触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示临床对比情况,响应于对对比显示界面的第二触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况。
17.因此,通过根据触发显示对应的比对情况,而非将所有的对比情况同时显示在一个界面上,本技术提供的方法能够节约显示空间。
18.其中,方法还包括:响应于在对比显示界面的标题编辑触发操作,将对比显示界面的第二标题调整为可编辑状态,并基于输入的标题信息更新第二标题;响应于在对比显示界面上的第二下载触发操作,下载所选择的队列对比情况;在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的基因情况显示区的导出操作,导出基因情况显示区中所选择的基因情况,其中,基因情况显示区用于显示目标队列和参考队列中的各基因情况;在第二区域显示生物组学比对情况的情况下,获取在第二区域的第二搜索区输入的基因名称,从目标队列和/或参考队列的医学数据中查找出输入的基因名称的相关基因情况,并在基因情况显示区更新显示相关基因情况;在第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的显著性展示项的选择操作,在基因情况显示区中只显示具有显著性效应的基因情况。
19.因此,用户可以更改标题、下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的相关基因情况,方便用户对队列数据以及分析结果进行管理。
20.其中,基因图谱包括目标队列中各目标对象的突变基因数量情况和目标队列中各基因发生突变的对象数量情况。
21.因此,通过基因图谱能够直观显示各突变基因的多方面情况。
22.其中,对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,还包括:响应于第三触发操作,统计得到目标队列的临床统计信息和组学类型统计信息,组学类型统计信息包括目标队列中各目标对象的基因检测文件的类型。
23.因此,通过响应于第三触发操作,还可统计临床统计信息以及组学类型统计信息,使得数据分析结果更丰富。
24.其中,基因图谱采用热力图和柱形图的组合图表示,热力图用于表示目标队列中各基因发生突变的热度分布,柱形图包括第一柱形图和第二柱形图,第一柱形图用于表示目标队列中各目标对象的突变基因数量情况,第二柱形图用于表示目标队列中各基因发生突变的对象数量情况;和/或,基因图谱、临床统计信息和组学类型统计信息均采用图表进行表示,且显示在同一显示界面上。
25.因此,通过使用热力图和柱形图的组合图进行表示,能够更为直观的显示各突变基因的基本情况。
26.其中,显示目标对象的医学数据分析结果,包括:在生存分析显示界面的不同区域显示目标队列的第三队列情况和生存分析结果,第三队列情况包括目标队列的总对象数量、目标队列中所选择的有效对象数量、有效对象数量在总对象数量中的占比;和/或,方法还包括以下至少一个步骤:响应于在生存分析显示界面上的结果导出操作,导出生存分析结果;根据输入的关键参数,从生存分析结果查找出与关键参数匹配的结果数据,并显示和/或导出结果数据。
27.因此,通过显示第三队列情况,方便查看。以及通过在生存分析显示界面上的结果导出操作,能够导出生存分析结果。并且,还可根据输入的关键参数,能够对分析结果进行筛选并显示筛选结果。
28.其中,在响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据之前,方法还包括:检测到对数据管理平台的登录,显示数据管理平台的主界面;响应于在主界面的分析模块选择操作,显示数据管理平台的数据分析界面;分析触发操作是在数据分析界面进行的;获取目标队列的医学数据,包括:将输入至数据管理平台的数据,作为目标队列的医学数据,或者,将选择的数据管理平台中的医学数据,作为目标队列的医学数据。
29.因此,通过提供多种获取目标队列的医学数据的方式,提高数据获取的灵活度。
30.本技术提供了一种数据管理平台,包括:响应触发子模块,用于响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,目标队列包含若干目标对象,目标队列的医学数据包括若干目标对象的生物组学数据;数据分析子模块,用于对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果;结果显示子模块,用于显示目标队列的医学数据分析结果。
31.本技术提供了一种电子设备,包括存储器和处理器,处理器用于执行存储器中存储的程序指令,以实现上述医学数据分析方法。
32.本技术提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有程序指令,程序指令被处理器执行时实现上述医学数据分析方法。
33.上述方案,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于用户对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
34.应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,而非限制本技术。
附图说明
35.此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分,这些附图示出了符合本技术的实施例,并与说明书一起用于说明本技术的技术方案。
36.图1是本技术医学数据分析方法一实施例的流程示意图;
37.图2是本技术医学数据分析方法一实施例示出数据分析界面的显示示意图;
38.图3是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于检索界面的显示示意图;
39.图4是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于数据驾驶舱界面的显示示意图;
40.图5是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于课题界面的显示示意图;
41.图6是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于数据存储界面的显示示意图;
42.图7是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于用户数据界面的显示示意图;
43.图8是本技术医学数据分析方法一实施例示出队列情况显示界面的显示示意图;
44.图9是本技术医学数据分析方法一实施例示出对比显示界面的第一示意图;
45.图10是本技术医学数据分析方法一实施例示出对比显示界面的第二示意图;
46.图11是本技术医学数据分析方法一实施例示出基因图谱显示界面的显示示意图;
47.图12是本技术医学数据分析方法一实施例示出生存分析显示界面的显示示意图;
48.图13是本技术数据管理平台一实施例的结构示意图;
49.图14是本技术电子设备一实施例的结构示意图;
50.图15是本技术计算机可读存储介质一实施例的结构示意图。
具体实施方式
51.下面结合说明书附图,对本技术实施例的方案进行详细说明。
52.以下描述中,为了说明而不是为了限定,提出了诸如特定系统结构、接口、技术之类的具体细节,以便透彻理解本技术。
53.本文中术语“和/或”,仅仅是一种描述关联对象的关联关系,表示可以存在三种关系,例如,a和/或b,可以表示:单独存在a,同时存在a和b,单独存在b这三种情况。另外,本文中字符“/”,一般表示前后关联对象是一种“或”的关系。此外,本文中的“多”表示两个或者多于两个。另外,本文中术语“至少一种”表示多种中的任意一种或多种中的至少两种的任意组合,例如,包括a、b、c中的至少一种,可以表示包括从a、b和c构成的集合中选择的任意一个或多个元素。
54.请参阅图1,图1是本技术医学数据分析方法一实施例的流程示意图。具体而言,可
以包括如下步骤:
55.步骤s11:响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,目标队列包含若干目标对象,目标队列的医学数据包括若干目标对象的生物组学数据。
56.目标队列可以是数据管理平台中创建的任一队列。其中,目标队列可以是由用户自行创建的,也可以是共享其他用户创建的。示例性地,
57.数据管理平台为可视化平台,能够实现对医学数据的存储以及可视化管理分析等操作,能够辅助医学工作者更高效地完成相关的研究工作。其中,该数据管理平台的输入可以包括各目标对象的基因检测结果以及病例信息。平台能够从基因检测结果以及病例信息中获取该目标对象对应的生物组学数据以及临床数据。另一些公开实施例中,各目标对象的生物组学数据和临床数据也可以由用户在手动输入接口输入。
58.其中,目标对象可以是患者,目标对象的临床数据可以是患者的临床数据,目标对象的生物组学数据可以是患者的生物组学数据。临床数据可以是目标对象的病例信息等。生物组学数据可以是目标对象在生物层面的信息,例如与基因相关的信息等。
59.步骤s12:对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果。
60.其中,分析触发操作可以包括多种,不同的分析触发操作可以对应不同的分析角度或分析方式,得到不同的医学数据分析结果。其中,分析的方式可以是对目标队列中各目标对象的不同生物层面的信息进行统计分析。
61.步骤s13:显示目标队列的医学数据分析结果。
62.具体地,在数据管理平台的可视化界面上显示该目标队列的医学数据分析结果。其中,显示的方式可以有多种,例如可以是表格、饼图等。
63.上述方案,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于用户对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
64.一些公开实施例中,至少部分医学数据分析结果采用图表进行显示。至少部分可以是部分,也可以是全部。图表的方式可以是以图的方式,也可以是表格的方式。
65.其中,生物组学数据包括目标对象的基本信息和基因检测文件中的至少一种。
66.其中,基因检测文件包含对目标对象的样本进行基因检测得到的基因检测结果。可选地,目标对象的基因检测结果包含目标对象的基因信息。其中,这里的样本可以是目标对象的dna片段。基因检测具体可以是基因测序。其中,基因信息和基因测序结果可以包括样本中检测到的基因、突变基因、基因突变类型和基因突变结果中的至少一种属性信息。其中,基因检测文件可以通过数据管理平台的接口导入到数据管理平台。通过对基因检测文件中的内容进行解析,得到样本中检测目标对象的基因信息。基因突变类型一般包括缺失突变、移码突变、插入突变。基因突变结果为基因突变类型的进一步细分,示例性地,基因突变结果可以包括stop-gained (终止密码子提前)、inframe-insertion(没有发生移码突变的插入突变)以及 inframe-deletion(没有发生移码突变的缺失突变)等等。
67.其中,医学数据还包括目标对象的临床数据。其中,临床数据包括目标对象的基本信息和疾病信息。
68.其中,目标对象的基本信息具体可以是目标对象的标识信息、当前年龄、性别中的至少一种属性信息。其中,目标对象的标识信息可以是姓名、编号等。其中,当目标对象已离
世,则目标对象的当前年龄可以是离世时的年龄。疾病信息可以包括疾病类型、病灶以及患病年龄、病理分期中的至少一种属性信息。其中,疾病类型包括肺癌、肝癌等任意疾病。病灶可以是原发灶,即引起该疾病的肿瘤起源的位置,例如疾病类型为肺癌时,且因为肺癌的肿瘤起源为肺部,肿瘤未发生过转移,则病灶为肺部。患病年龄可以是确诊某疾病类型的年龄。肿瘤病理分期能够反映肿瘤的侵袭转移程度,是评价恶性肿瘤侵袭转移范围、病程进展程度的指标。
69.一些公开实施例中,在执行上述步骤s11之前,还包括以下步骤:
70.检测到对数据管理平台的登录,显示数据管理平台的主界面。其中,登录数据管理平台的方式很多,具体地,可以通过账号密码的方式登录、人脸识别登录、扫码登录等等方式登录数据管理平台。请同时参见图2,图2是本技术医学数据分析方法一实施例示出数据分析界面的显示示意图。
71.如图2所示,数据分析界面的上方为数据管理平台的主界面。主界面上包括数据驾驶舱按钮、课题纵览按钮、数据检索按钮、数据分析按钮、数据存储按钮以及我的数据按钮。每个按钮对应一个模块,每个模块具有的功能存在不同。数据驾驶舱按钮对应数据驾驶舱模块、课题纵览按钮对应课题纵览模块、数据检索按钮对应数据检索模块、数据分析按钮对应数据分析模块、数据存储按钮对应数据存储模块以及我的数据按钮对应用户数据模块,点击各模块对应的按钮进入各个模块对应的显示界面。
72.一些应用场景中,在主界面上点击数据检索按钮,则进入检索界面。请同时参见图3,图3是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于检索界面的显示示意图。数据管理平台的检索界面的显示示意图如图3所示。其中,在检索界面中,可以获取输入的至少一个检索维度的检索条件。然后从数据管理平台的医学数据池中检索出与检索条件匹配的若干条医学数据,以作为目标医学数据。最后,按照至少一个反馈维度进行反馈,其中,反馈包括与目标医学数据相关的目标信息。本公开实施例中,提供的检索维度可以包括目标对象、基因和突变中的至少一者。本公开实施例提供的反馈维度包括目标对象、基因和突变中的至少一者。在检索界面中,能够响应于第一选择操作,将所选择的第一维度项对应的检索维度作为目标检索维度,并获取在检索区域的第二子区域输入的目标检索维度的检索条件。其中,每个检索维度对应有第一维度项,每个反馈维度对应有第二维度项。以及,还可响应于在检索界面上的第二选择操作,将所选择的第二维度项对应的反馈维度作为目标反馈维度,并在检索界面的结果显示区域的结果子区域,显示目标反馈维度对应的目标信息。其中,每个反馈维度对应的目标信息可以不同,目标信息可以是检索到的医学数据信息以及关于各医学数据信息的统计情况。
73.一些应用场景中,点击数据驾驶舱按钮,能够显示数据驾驶舱界面。请参见图 4,图4是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于数据驾驶舱界面的显示示意图。在数据驾驶舱界面能够在检测到对数据管理平台的第一预设操作之后,获取数据管理平台的平台数据情况,然后显示平台数据情况。平台数据情况是对数据管理平台中的医学数据进行统计得到。示例性地,平台数据情况包括以下至少一种数据情况:数据管理平台的整体数据情况、基于临床数据统计得到的临床数据情况、基于生物组学数据统计得到的生物数据情况。
74.一些应用场景中,在主界面点击课题纵览按钮,则进入课题界面。请同时参见图5,图5是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于课题界面的显示示意图。其中,在课题界
面中,能够获取数据管理平台中若干课题的基础信息并在课题界面上显示壳体的基础信息。当然,还可显示在课题界面上选择的课题的相关统计信息。该课题的统计信息是基于课题关联的医学数据进行统计得到的。示例性地,课题的统计信息可以包括课题的概述信息、按照基因检测文件类型进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量、按照基因检测手段进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量、按照病灶进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量。其中,通过点击课题的信息进入检索界面或者数据存储界面,以便查看该课题更详细的医学数据信息。
75.一些应用场景中,在主界面点击数据存储按钮,则进入数据存储界面。请同时参见图6,图6是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于数据存储界面的显示示意图。其中,在数据存储界面中,能够根据输入的文件信息,检索出与文件信息匹配的基因检测文件,并在数据存储界面进行显示该基因检测文件的相关信息,并且可以根据下载操作下载对应的基因检测文件。示例性地,基因检测文件的相关信息可以包括各个基因检测文件的基础信息以及关于各基础信息的统计情况。
76.一些应用场景中,通过在主界面点击我的数据按钮,则进入用户数据界面。请同时参见图7,图7是本技术医学数据分析方法一实施例示出关于用户数据界面的显示示意图。在用户数据界面中能够显示创建的目标对象队列以及基因序列的相关信息。其中,目标对象队列和基因序列可以是在检索界面基于数据检索结果创建的。具体地,用户数据界面上显示了目标对象队列和生物标志物队列的目标信息。目标对象队列的目标信息包括目标对象队列的名称和该队列中包含的目标对象的数量。生物标志物队列的目标信息包括生物标志物队列的名称和该队列中包含的生物标志物的数量。在用户数据界面还可响应于对目标对象的数量或生物标志物的数量的点击操作,显示该队列对应的数据信息。目标对象队列的数据信息包括目标对象的信息。其中,生物标志物队列的数据信息包括生物标志物队列中各生物标志物的标签信息。标签信息表示生物标志物是否发生突变。其中,显示各队列的信息之后,用户数据界面还可响应于对显示的查看接口的第二预设操作,跳转至数据管理平台的数据存储界面,并在数据存储界面显示所选择的目标对象队列的第二目标信息,其中,第二目标信息为目标对象队列包含的基因检测文件的信息。
77.响应于在主界面的分析模块选择操作,显示数据管理平台的数据分析界面。分析触发操作是用户在数据分析界面进行的。
78.其中,获取目标队列的医学数据的方式也可以是:将输入至数据管理平台的数据,作为目标队列的医学数据。或,将所选择的数据管理平台中的医学数据,作为目标队列的医学数据。示例性地,可以在数据管理平台中为各目标对象的医学数据创建队列,并从创建的队列中选择至少一个队列作为目标队列。
79.一些公开实施例中,上述步骤s12包括以下任意一个或多个步骤:
80.响应于在数据分析界面上的第一触发操作,对目标队列中的医学数据进行统计,得到目标队列的队列数据统计情况。
81.如图2所示,数据分析界面包括四个子模块,分别为队列详情子模块、队列比较子模块、基因图谱子模块以及生存分析子模块。
82.其中,第一触发操作可以是对队列详情子模块的选择操作。
83.响应于在数据分析界面上的第二触发操作,将目标队列与参考队列的医学数据进
行对比,得到目标队列的队列对比情况。第二触发操作可以是对队列比较子模块的选择操作。
84.响应于在数据分析界面上的第三触发操作,利用目标队列的医学数据进行基因统计,得到目标队列的基因图谱。其中,基因图谱用于表征目标队列中的目标对象的基因突变情况。第三触发操作可以是对基因图谱子模块的选择操作。
85.响应于在数据分析界面上的第四触发操作,利用目标队列的医学数据进行生存分析,得到目标队列的生存分析结果。第四触发操作可以是对生存分析子模块的选择操作。
86.通过根据不同的触发操作,对目标队列的医学数据进行不同的分析,能够提高数据分析的灵活度。
87.一些公开实施例中,数据分析界面包括分析应用项以及分析结果项。响应于对分析应用项的选择操作,数据分析界面显示上述队列详情子模块、队列比较子模块、基因图谱子模块以及生存分析子模块。响应于对分析结果项的选择操作,显示数据分析结果界面。数据分析结果界面中显示预设时间段内所有的分析结果标签。响应于对分析结果标签的选择操作,在数据分析结果界面显示该标签对应的数据分析结果。示例性地,分析结果标签排列在数据分析界面左侧的列表子区域,右侧的结果子区域用于显示各标签对应的数据分析结果。
88.其中,队列数据统计情况包括第一队列情况、对临床数据统计得到的临床统计情况和对生物组学数据统计得到的生物组学统计情况。通过对第一队列情况进行展示,使得能够直观看到第一队列的整体情况。
89.一些公开实施例中,临床统计情况包括以下至少一者:目标队列中不同性别的比例、目标队列中不同患病年龄区间的比例、目标队列的生存曲线。患病年龄区间可以是首次确诊年龄的区间。首次确诊具体可以是首次确诊癌症的时间。其中,目标队列的生存曲线的横坐标可以是时间,纵坐标可以是生存率,曲线上的每一个点代表了该时间点上目标对象的生存率,随着观察时间的增长,生存率逐渐降低。另一些公开实施例中,生存曲线还可以是用于表示检索得到的各目标对象之间的各个生存时长差异的数量占所有生存时长差异的数量的比例。示例性地,若检索得到3 个目标对象,目标对象a的生存时长为3年零1个月,目标对象b的生存时长为3 年零3个月,目标对象c的生存时长为3年零4个月,目标对象d的生成时长为3 年零4个月,其中,各目标对象之间的生存时长差异包括目标对象a与目标对象b 之间的2个月,目标对象a与目标对象c之间的3个月,目标对象a与目标对象d 之间的3个月,目标对象b与目标对象c之间的1个月,目标对象b与目标对象d 之间的1个月,目标对象c与目标对象d之间的0个月,此时生存时长差异为1个月的比例为2/6=1/3。
90.其中,生物组学统计情况包括若干第一预设基因的对象数量统计情况。其中,第一预设基因可以是突变频率满足预设要求的若干突变基因。第一预设基因的目标对象数量统计情况可以是展示了top20高频体细胞突变基因所处患者的人数。
91.一些公开实施例中,不同的队列数据统计情况显示在队列情况显示界面的不同区域。其中,不同队列数据统计情况之间不存在重叠,方便查看。
92.本公开实施例提供的医学数据分析方法还可包括以下至少一个步骤:
93.响应于对队列情况显示界面的标题编辑触发操作,将队列情况显示界面的第一标题调整为可编辑状态,并基于输入标题信息更新第一标题。请同时参见图8,图8 是本技术
医学数据分析方法一实施例示出队列情况显示界面的显示示意图。如图8 所示,此次数据分析的标题为“分析任务72”,用于可以通过点击标题旁边的更改按钮对此次数据分析的标题进行更改。
94.响应于在队列情况显示界面上的更新触发操作,重新统计并显示选择的队列数据统计情况。示例性地,至少部分队列数据统计情况有对应的更新按钮,通过点击该更新按钮,使得重新统计并显示选择的队列数据统计情况。
95.响应于在队列情况显示界面上的第一下载触发操作,下载所选择的队列数据统计情况。示例性地,至少部分队列数据统计情况有对应的下载按钮,通过点击该下载按钮能够下载所选择的队列数据统计情况。
96.获取在队列情况显示界面的第一搜索区输入的基因名称,从目标队列的医学数据中查找出与输入的基因名称的关联数据,并在队列情况显示界面显示关联数据。其中,基因名称的关联数据可以包括该基因所在的目标对象、以及目标对象的基本信息等。具体地,该关联数据与上述各队列数据统计情况显示在队列情况显示界面的不同显示位置。
97.用户可以更改标题、重新统计用户选择的队列数据统计情况以及下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的关联数据,方便用户对队列数据以及分析结果进行管理。
98.一些公开实施例中,队列对比情况包括第二队列情况、对临床数据进行比对得到的临床对比情况和对生物组学数据比对得到的生物组学比对情况。
99.其中,第二队列情况包括目标队列和参考队列的名称、目标队列和参考队列的对象数量中的至少一者。请同时参见图9,图9是本技术医学数据分析方法一实施例示出对比显示界面的第一示意图。如图9所示,目标队列和参考队列分别可以是队列s1和队列s2。其中,队列s1的名称是tcga-肝癌-eef1a1 t432s野生型,以及队列的名称是s2tcga-肝癌-eef1a1 t432s野生型。其中,队列s1中包括373 个患者,队列s2中包括4个患者。
100.临床对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列中不同性别的对象数量差异、目标队列和参考队列中患病年龄的情况差异、目标队列和参考队列的生存曲线。
101.目标队列和参考队列中不同性别的对象数量差异具体可以使用柱状图的形式呈现。不同颜色的柱状图可以用于表示不同的队列。当然,目标队列和参考队列中不同性别的对象数量差异包括各性别在不同队列中的占比,具体如图9所示。目标队列和参考队列中患病年龄的情况差异具体可以是同一患病年龄段在不同队列中所占比例,或各患病年龄段在不同队列中的情况差异。目标队列和参考队列的生存曲线可以是将这两个队列的生存曲线用一个曲线图中不同的颜色表示,具体如图9所示。
102.其中,生物组学数据对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列的基因突变频率对比情况、目标队列和参考队列中突变频率大于预设阈值的突变基因的对比情况、若干第二预设基因在目标队列和参考队列中的突变频率对比情况、目标队列和参考队列中的各基因情况。
103.其中,目标队列和参考队列的基因突变频率对比情况包括各突变基因在目标队列中的第一突变频率与在参考队列中的第二突变频率之间的比例与假定值(p-value) 之间的关系。具体地,突变基因在目标队列中的第一突变频率为包含该突变基因的目标对象的数量与该目标队列中的总目标对象的数量之间的比值。突变基因在参考队列中的第二突变频率为包含该突变基因的目标对象的数量与该参考队列中的总目标对象的数量之间的比
值。其中,p-value的计算方式可参见一般的计算方式,此处不做过多叙述。
104.其中,预设阈值的获取方式可以是预先设定,也可以是根据两个队列中各突变基因的突变频率动态调整的。示例性地,预设阈值可以是两个队列中,突变基因频率排名为第一预设数量位的突变基因的频率作为预设阈值。其中,排名为第一预设数量位可以是目标队列或参考队列中排名为第一预设数量位的突变基因,也可以是共同所有的突变基因中排名为第一预设数量位的突变基因。目标队列和参考队列中突变频率大于预设阈值的突变基因的对比情况具体为突变基因在目标队列和参考队列中的频率比对情况。
105.若干第二预设基因可以是在目标队列或参考队列中的突变频率排名前第二预设数量位的突变基因。示例性地,目标队列中的若干第二预设基因可以是突变频率排名前第二预设数量位的突变基因,参考队列中的若干第二预设基因可以是突变频率排名前第二预设数量位的突变基因,或者,目标队列和参考队列中的若干第二预设基因还可以是目标队列和参考队列中共同存在的突变基因中排名前第二预设数量位的突变基因,或者若干第二预设基因还可以是其中一个队列中的前第二预设数量位的基因。若干第二预设基因在目标队列和参考队列中的突变频率对比情况具体可以使用柱状图的形式呈现,不同颜色代表了不同的队列。
106.目标队列和参考队列中的各基因情况包括各突变基因的情况。具体可以是若干第二预设基因的相关情况。其中,各突变基因的情况包括以下任意一个或多个内容:该突变基因所属的染色体区带、在目标队列中的第一突变频率、在参考队列中的第二突变频率、第一突变频率和第二突变频率之间的比值、p-value、q值(q-value) 以及有富集效应的队列的名称。其中,计算p值和q值的方式可参见一般统计学领域内的计算方式,此处不做过多叙述。其中,有富集效应的队列与该突变基因在两个队列中的突变频率相关。具体地,若该突变基因在目标队列中的第一突变频率大于该突变基因在参考队列中的第二突变频率,则该突变基因对应的有富集效应的队列为目标队列。
107.通过对两个队列的临床数据进行对比以及生物组学数据进行对比,使得能够直观的展示两个队列在多个层面之间的相同点和不同点。
108.一些公开实施例中,显示目标队列的医学数据分析结果包括:
109.在对比显示界面的第一区域显示第二队列情况。以及,响应于对对比显示界面的第一触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示临床对比情况。以及,响应于对对比显示界面的第二触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况。其中,第一触发键可以是“临床信息”按钮,第二触发键可以是“基因信息”按钮。在同一时刻第二区域内只显示临床对比情况和生物组学比对情况中的一者。通过根据触发显示对应的比对情况,而非将所有的对比情况同时显示在一个界面上,本技术提供的方法能够节约显示空间。
110.其中,本公开实施例提供的医学数据分析方法还包括以下任意一个或多个步骤:
111.响应于在对比显示界面的标题编辑触发操作,将对比显示揭面的第二标题调整为可编辑状态,并基于输入的标题信息更新第二标题。示例性地,请参见图9,图9 中当前的第二标题为“tcga-肝癌-eef1a1 t342s”,第二标题右侧有对应的触发键,通过点击该触发键能够将第二标题调整为可编辑状态,以此实现对第二标题进行调整。
112.响应于在对比显示界面上的第二下载触发操作,下载选择的队列对比情况。示例性地,各个队列对比情况的旁边都有对应的下载键,通过点击下载键,下载对应的队列对比
情况。
113.在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的基因情况显示区的导出操作,导出基因情况显示区中被选择的基因情况。其中,基因情况显示区用于显示目标队列和参考队列中的各基因情况。请同时参见图10,图10是本技术医学数据分析方法一实施例示出对比显示界面的第二示意图。如图 10所示,显示的基因情况的右上方设置有导出按钮,通过点击导出按钮,将选中的基因的情况导出。
114.在第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的显著性展示项的选择操作,在基因情况显示区中只显示具有显著性效应的基因情况。其中,显著性效应具体可以是第一突变频率和/或第二突变频率大于第一预设值、第一突变频率和第二突变频率之间的比值大于第二预设值,p值和/或q值满足设定条件中的任意一者或多者。
115.用户可以更改标题、下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的相关基因情况,方便用户对队列数据以及分析结果进行管理。
116.一些公开实施例中,基因图谱包括目标队列中各目标对象的突变基因数量情况和目标队列中各基因发生突变的对象数量情况。目标队列中各目标对象的突变基因数量情况可以是目标队列中各目标对象中发生突变的基因的总数量。目标对象中各基因发生突变的对象数量情况指的是目标队列中包含该突变基因的目标对象的数量。通过基因图谱能够直观显示各突变基因的多方面情况。
117.一些公开实施例中,上述步骤s12还包括以下步骤:
118.响应于第三触发操作,统计得到目标队列的临床统计信息和组学类型统计信息。其中,组学类型统计信息包括目标队列中各目标对象的基因检测文件的类型。其中,组学类型统计信息包括目标队列中各目标对象的基因检测文件的类型。示例性地,基因检测文件的类型可以包括对比数据文件、原始数据文件、snv和indel文件以及cnv文件。原始数据为该目标对象的肿瘤组织对应的基因测序结果的文件,对比数据是该目标对象的正常组织对应的基因测序结果的文件,snv和indel文件指的是通过snv和indel检测方法对该目标对象的样本进行检测得到的文件,cnv数量文件指的是通过cnv检测方法对目标对象的样本进行检测得到的基因测序结果的文件。通过响应于第三触发操作,还可统计临床统计信息以及组学类型统计信息,使得数据分析结果更丰富。
119.其中,基因图谱、临床统计信息以及组学类型统计信息均采用图表进行表示,且显示在同一显示界面上。基因图谱、临床统计信息以及组学类型统计信息具体显示在基因图谱显示界面上。可选地,基因图谱采用热力图和柱形图的组合图表示。热力图用于表示目标队列中各基因发生突变的热度分布。柱形图包括第一柱形图和第二柱形图,第一柱形图用于表示目标队列中各目标对象的突变基因数量情况。第二柱形图用于表示目标队列中各基因发生突变的对象数量情况。请同时参见图11,图11是本技术医学数据分析方法一实施例示出基因图谱显示界面的显示示意图。如图11所示,热力图的横轴为目标队列中各目标对象的名称,热力图的纵轴为各突变基因的名称。示例性地,若热力图中第一行表示突变基因a,热力图中的第一列表
120.示目标对象b,若目标对象b中包含该突变基因a,则第一行第一列的位置处热力
121.值不为0,若目标对象b中不包含该突变基因a,则第一行第一列的位置处热力值为0。
122.第一柱形图位于热力图上方,第一柱形图的横轴表示目标队列中各个目标对象的名称,纵轴表示各目标对象中所包含的突变基因数量。示例性地,第一柱形图中横轴第一个表示目标对象a,且目标对象a中包含b个突变基因,则第一个柱形的高度为b。第二柱形图位于热力图的右侧,第二柱形图的横轴表示目标队列中存在的突变基因的名称,纵轴表示各突变基因所处目标对象的数量。示例性地,第二柱形图中横轴第一个表示突变基因c,且目标队列中有d个目标对象中包括突变基因 c,则第二柱形图中第一个柱形的高度为d。
123.通过使用热力图和柱形图的组合图进行表示,能够更为直观的显示各突变基因的基本情况。
124.一些公开实施例中,在生存分析显示界面的不同区域显示目标队列的第三队列情况和生存分析结果。第三队列情况包括目标队列的总对象数量、目标队列中所选择的有效对象数量、以及有效对象数量在总对象数量中的占比。第三队列情况还包括队列名称。有效目标对象数量可以是经筛选后满足保留条件的目标对象数,筛选方式可以是统计学筛选,去除不具有统计意义的目标对象。有效对象数量在总对象数量中的占比为有效目标对象数量与总目标对象之间的比例。请同时参见图12,图 12是本技术医学数据分析方法一实施例示出生存分析显示界面的显示示意图。如图 12所示,生存分析结果包括以下任意一个或多个内容:多因素cox分析结果、观察变量分布情况。
125.多因素cox分析结果包括变量、风险比(hr)、自信区间(ci)以及p值。其中,变量为突变基因名称、风险比包括该突变基因导致恶性肿瘤的概率。自信区间为用户设置,可以用于表示风险比的容忍区间。另一些公开实施例中,风险比还可用于表示目标队列中生存时长的集中点,自信区间还可用于表示生存时长的容忍区间。
126.观察变量分布情况包括观察变量名称、变量分类、分组、不同分组中所含目标对象的数量、以及不同分组中所含目标对象的占比。观察变量名称为突变基因的名称、变量分类包括野生型和突变型。分组包括观察组和参考组。不同分组中所含目标对象的数量具体为目标队列中属于各组的目标对象的数量。占比包括各组中目标对象的数量与目标队列中目标对象的总数之间的比例。观察变量分布情况可以用于后续分析数据。
127.一些公开实施例中,上述步骤s13包括以下至少一个步骤:
128.响应于在生存分析显示界面的导出操作,导出生存分析结果。示例性地,接收对导出按钮的点击操作,导出所选择的变量对应的多因素cox分析结果。
129.以及,根据输入的关键参数,从生存分析结果查找处与关键参数匹配的结果数据。示例性地,获取输入或选择的p值,对多因素cox分析结果进行筛选。另一些公开实施例中,接收对创建/编辑生物标志物列表的操作指令,将选择的变量对应的多因素cox分析结果创建列表,该列表可以用于后续生物学分析。
130.通过显示第三队列情况,方便查看。以及通过在生存分析显示界面上的结果导出操作,能够导出生存分析结果。并且,还可根据输入的关键参数,能够对分析结果进行筛选并显示筛选结果。
131.一些公开实施例中,在获取输入的至少一个检索维度的检索条件之前,包括以下步骤:
132.检测到对数据管理平台的登录,显示数据管理平台的主界面。然后,响应于在主界面的检索模块选择操作,显示数据管理平台的检索界面。其中,登录数据管理平台的方式很
多,例如可以通过账号密码的方式登录、人脸识别登录、扫码登录等等。
133.一些公开实施例中,本公开实施例提供的方法应用与目标平台的服务器。上述步骤s11可以包括以下步骤:
134.接收到用户终端发送的数据获取请求。其中,数据获取请求是用户终端响应于用户的分析触发操作生成的。
135.步骤s13包括以下步骤:向用户终端发送对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,以使用户终端显示目标队列的医学数据分析结果。
136.另一些公开实施例中,本公开实施例提供的方法也可应用于安装有目标平台的设备。设备响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,并显示目标队列的医学数据分析结果。
137.其中,医学数据分析方法的执行主体可以是数据管理平台,例如,医学数据分析方法可以由相机、手机、具备图像采集功能的笔记本电脑等终端设备或服务器或其它处理设备执行,其中,终端设备可以为用户设备(user equipment,ue)、移动设备、用户终端、终端、蜂窝电话、无绳电话、个人数字处理(personal digitalassistant,pda)、手持设备、计算设备、车载设备、可穿戴设备等。在一些可能的实现方式中,该医学数据分析方法可以通过处理器调用存储器中存储的计算机可读指令的方式来实现。
138.请参阅图13,图13是本技术数据管理平台一实施例的结构示意图。数据管理平台40包括响应触发子模块41、数据分析子模块42以及结果显示子模块43。响应触发子模块41,用于响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,目标队列包含若干目标对象,目标队列的医学数据包括若干目标对象的生物组学数据;数据分析子模块42,用于对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果;结果显示子模块43,用于显示目标队列的医学数据分析结果。
139.上述方案,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
140.一些公开实施例中,数据分析子模块42对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,包括以下任意一个或多个步骤:响应于在数据分析界面上的第一触发操作,对目标队列中的医学数据进行统计,得到目标队列的队列数据统计情况;响应于在数据分析界面上的第二触发操作,将目标队列与参考队列的医学数据进行对比,得到目标队列的队列对比情况;响应于在数据分析界面上的第三触发操作,利用目标队列的医学数据进行基因统计,得到目标队列的基因图谱,基因图谱用于表征目标队列中的目标对象的基因突变情况;响应于在数据分析界面上的第四触发操作,利用目标队列的医学数据进行生存分析,得到目标队列的生存分析结果。
141.上述方案,通过根据不同的触发操作,对目标队列的医学数据进行不同的分析,能够提高数据分析的灵活度。
142.一些公开实施例中,至少部分医学数据分析结果采用图表进行显示;和/或,医学数据还包括目标对象的临床数据,临床数据包括目标对象的基本信息和疾病信息,生物组学数据包括目标对象的基因信息和基因检测文件中的至少一种,基因检测文件包含对目标对象的样本进行基因检测得到基因检测结果。
143.上述方案,通过使用图标进行显示,能够提高分析结果的可读性。通过对目标对象的临床数据进行分析,能够得到目标队列中不同目标对象的临床数据的共性,以便于后续分析。
144.一些公开实施例中,队列数据统计情况包括第一队列情况、对临床数据统计得到的临床统计情况和对生物组学数据统计得到的生物组学统计情况;第一队列情况包括目标队列的名称、目标队列的对象数量中的至少一者;临床统计情况包括以下至少一者:目标队列中不同性别的比例、目标队列中不同患病年龄区间的比例、目标队列的生存曲线;生物组学统计情况包括若干第一预设基因的对象数量统计情况。
145.上述方案,通过对第一队列情况进行展示,使得能够直观看到第一队列的整体情况。
146.一些公开实施例中,不同的队列数据统计情况显示在队列情况显示界面的不同区域;结果显示子模块43还包括以下至少一个步骤:响应于对队列情况显示界面的标题编辑触发操作,将队列情况显示界面的第一标题调整为可编辑状态,并基于输入标题信息更新第一标题;响应于在队列情况显示界面上的更新触发操作,重新统计并显示选择的队列数据统计情况;响应于在队列情况显示界面上的第一下载触发操作,下载选择的队列数据统计情况;获取在队列情况显示界面的第一搜索区输入的基因名称,从目标队列的医学数据中查找出与输入的基因名称的关联数据,并在队列情况显示界面显示关联数据。
147.上述方案,可以更改标题、重新统计选择的队列数据统计情况以及下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的关联数据,方便对队列数据以及分析结果进行管理。
148.一些公开实施例中,队列对比情况包括第二队列情况、对临床数据进行比对得到的临床对比情况和对生物组学数据比对得到的生物组学比对情况;第二队列情况包括目标队列和参考队列的名称、目标队列和参考队列的对象数量中的至少一者;临床对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列中不同性别的对象数量差异、目标队列和参考队列中患病年龄的情况差异、目标队列和参考队列的生存曲线;生物组学对比情况包括以下至少一者:目标队列和参考队列的基因突变频率对比情况、目标队列和参考队列中突变频率大于预设阈值的突变基因的对比情况、若干第二预设基因在目标队列和参考队列中的突变频率对比情况、目标队列和参考队列中的各基因情况。
149.上述方案,通过对两个队列的临床数据进行对比以及生物组学数据进行对比,使得能够直观的展示两个队列在多个层面之间的相同点和不同点。
150.一些公开实施例中,显示目标队列的医学数据分析结果,包括:在对比显示界面的第一区域显示第二队列情况;以及,响应于对对比显示界面的第一触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示临床对比情况,响应于对对比显示界面的第二触发键的触发,在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况。
151.上述方案,通过根据触发显示对应的比对情况,而非将所有的对比情况同时显示在一个界面上,本技术提供的方法能够节约显示空间。
152.一些公开实施例中,结果显示子模块43还用于:响应于在对比显示界面的标题编辑触发操作,将对比显示界面的第二标题调整为可编辑状态,并基于输入的标题信息更新第二标题;响应于在对比显示界面上的第二下载触发操作,下载所选择的队列对比情况;在对比显示界面的第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的基因情况
显示区的导出操作,导出基因情况显示区中被所选择的基因情况,其中,基因情况显示区用于显示目标队列和参考队列中的各基因情况;在第二区域显示生物组学比对情况的情况下,获取在第二区域的第二搜索区输入的基因名称,从目标队列和/或参考队列的医学数据中查找出输入的基因名称的相关基因情况,并在基因情况显示区更新显示相关基因情况;在第二区域显示生物组学比对情况的情况下,响应于对第二区域的显著性展示项的选择操作,在基因情况显示区中只显示具有显著性效应的基因情况。
153.上述方案,可以更改标题、下载对应的统计情况,还能查找对应的基因的相关基因情况,方便对队列数据以及分析结果进行管理。
154.一些公开实施例中,基因图谱包括目标队列中各目标对象的突变基因数量情况和目标队列中各基因发生突变的对象数量情况。
155.上述方案,通过基因图谱能够直观显示各突变基因的多方面情况。
156.一些公开实施例中,数据分析子模块42对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果,还用于:响应于第三触发操作,统计得到目标队列的临床统计信息和组学类型统计信息,组学类型统计信息包括目标队列中各目标对象的基因检测文件的类型。
157.上述方案,通过响应于第三触发操作,还可统计临床统计信息以及组学类型统计信息,使得数据分析结果更丰富。
158.一些公开实施例中,基因图谱采用热力图和柱形图的组合图表示,热力图用于表示目标队列中各基因发生突变的热度分布,柱形图包括第一柱形图和第二柱形图,第一柱形图用于表示目标队列中各目标对象的突变基因数量情况,第二柱形图用于表示目标队列中各基因发生突变的对象数量情况;和/或,基因图谱、临床统计信息和组学类型统计信息均采用图表进行表示,且显示在同一显示界面上。
159.上述方案,通过使用热力图和柱形图的组合图进行表示,能够更为直观的显示各突变基因的基本情况。
160.一些公开实施例中,结果显示子模块43显示目标对象的医学数据分析结果,包括:在生存分析显示界面的不同区域显示目标队列的第三队列情况和生存分析结果,第三队列情况包括目标队列的总对象数量、目标队列中所选择的有效对象数量、有效对象数量在总对象数量中的占比;和/或,方法还包括以下至少一个步骤:响应于在生存分析显示界面上的结果导出操作,导出生存分析结果;根据输入的关键参数,从生存分析结果查找出与关键参数匹配的结果数据,并显示和/或导出结果数据。
161.上述方案,通过显示第三队列情况,方便查看。以及通过在生存分析显示界面上的结果导出操作,能够导出生存分析结果。并且,还可根据输入的关键参数,能够对分析结果进行筛选并显示筛选结果。
162.一些公开实施例中,在响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据之前,响应触发子模块41还用于:检测到对数据管理平台的登录,显示数据管理平台的主界面;响应于在主界面的分析模块选择操作,显示数据管理平台的数据分析界面;分析触发操作是在数据分析界面进行的;获取目标队列的医学数据,包括:将输入至数据管理平台的数据,作为目标队列的医学数据,或者,将所选择的数据管理平台中的医学数据,作为目标队列的医学数据。
163.上述方案,通过提供多种获取目标队列的医学数据的方式,提高数据获取的灵活度。
164.一些公开实施例中,数据管理平台40中还包括课题纵览模块(图未示)、数据检索模块(图未示)、用户数据模块(图未示)、数据存储模块(图未示)以及数据驾驶舱模块(图未示)。
165.数据检索模块可以用于获取输入的至少一个检索维度的检索条件。然后从数据管理平台的医学数据池中检索出与检索条件匹配的若干条医学数据,以作为目标医学数据。最后,按照至少一个反馈维度进行反馈,其中,反馈包括与目标医学数据相关的目标信息。本公开实施例中,提供的检索维度可以包括目标对象、基因和突变中的至少一者。本公开实施例提供的反馈维度包括目标对象、基因和突变中的至少一者。在检索界面中,能够响应于第一选择操作,将所选择的第一维度项对应的检索维度作为目标检索维度,并获取在检索区域的第二子区域输入的目标检索维度的检索条件。其中,每个检索维度对应有第一维度项,每个反馈维度对应有第二维度项。以及,还可响应于在检索界面上的第二选择操作,将所选择的第二维度项对应的反馈维度作为目标反馈维度,并在检索界面的结果显示区域的结果子区域,显示目标反馈维度对应的目标信息。其中,每个反馈维度对应的目标信息可以不同,目标信息可以是检索到的医学数据信息以及关于各医学数据信息的统计情况。
166.课题纵览模块,能够获取数据管理平台中若干课题的基础信息并在课题界面上显示壳体的基础信息。当然,还可显示在课题界面上选择的课题的相关统计信息。该课题的统计信息是基于课题关联的医学数据进行统计得到的。示例性地,课题的统计信息可以包括课题的概述信息、按照基因检测文件类型进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量、按照基因检测手段进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量、按照病灶进行统计的统计文件数量以及统计得到的目标对象数量。其中,通过点击课题的信息进入检索界面或者数据存储界面,以便查看该课题更详细的医学数据信息。
167.数据存储模块,能够根据输入的文件信息,检索出与文件信息匹配的基因检测文件,并在数据存储界面进行显示该基因检测文件的相关信息,并且可以根据下载操作下载对应的基因检测文件。示例性地,基因检测文件的相关信息可以包括各个基因检测文件的基础信息以及关于各基础信息的统计情况。
168.数据驾驶舱模块可以用于在检测到对数据管理平台的第一预设操作之后,获取数据管理平台的平台数据情况,然后显示平台数据情况。平台数据情况是对数据管理平台中的医学数据进行统计得到。示例性地,平台数据情况包括以下至少一种数据情况:数据管理平台的整体数据情况、基于临床数据统计得到的临床数据情况、基于生物组学数据统计得到的生物数据情况。
169.用户数据模块,能够用于显示创建的目标对象队列以及基因序列的相关信息。其中,目标对象队列和基因序列可以是在检索界面基于数据检索结果创建的。具体地,用户数据界面上显示了目标对象队列和生物标志物队列的目标信息。目标对象队列的目标信息包括目标对象队列的名称和该队列中包含的目标对象的数量。生物标志物队列的目标信息包括生物标志物队列的名称和该队列中包含的生物标志物的数量。在用户界面还可响应于对目标对象的数量或生物标志物的数量的点击操作,显示该队列对应的数据信息。目标对象队列的数据信息包括目标对象的信息。其中,生物标志物队列的数据信息包括生物标志物
队列中各生物标志物的标签信息。标签信息表示生物标志物是否发生突变。其中,显示各队列的信息之后,用户数据界面还可响应于对显示的查看接口的第二预设操作,跳转至数据管理平台的数据存储界面,并在数据存储界面显示选择的目标对象队列的第二目标信息,其中,第二目标信息为目标对象队列包含的基因检测文件的信息。
170.请参阅图14,图14是本技术电子设备一实施例的结构示意图。电子设备50包括存储器51和处理器52,处理器52用于执行存储器51中存储的程序指令,以实现上述任一医学数据分析方法实施例中的步骤。在一个具体的实施场景中,电子设备50可以包括但不限于:医疗设备、微型计算机、台式电脑、服务器,此外,电子设备50还可以包括笔记本电脑、平板电脑等移动设备,在此不做限定。
171.具体而言,处理器52用于控制其自身以及存储器51以实现上述任一医学数据分析方法实施例中的步骤。处理器52还可以称为cpu(central processing unit,中央处理单元)。处理器52可能是一种集成电路芯片,具有信号的处理能力。处理器 52还可以是通用处理器、数字信号处理器(digital signal processor,dsp)、专用集成电路(application specific integrated circuit,asic)、现场可编程门阵列 (field-programmable gate array,fpga)或者其他可编程逻辑器件、分立门或者晶体管逻辑器件、分立硬件组件。通用处理器可以是微处理器或者该处理器也可以是任何常规的处理器等。另外,处理器52可以由集成电路芯片共同实现。
172.上述方案,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
173.请参阅图15,图15是本技术计算机可读存储介质一实施例的结构示意图。计算机可读存储介质60存储有程序指令61,程序指令61被处理器执行时实现上述任一医学数据分析方法实施例中的步骤。
174.上述方案,通过响应于分析操作,获取目标队列的医学数据并对目标队列的医学数据进行分析,得到对应的医学数据分析结果并进行显示,相对于对目标队列的医学数据进行自主分析而言,本技术方案能够减少数据分析成本。
175.在一些实施例中,本公开实施例提供的系统具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
176.上文对各个实施例的描述倾向于强调各个实施例之间的不同之处,其相同或相似之处可以互相参考,为了简洁,本文不再赘述。
177.在本技术所提供的几个实施例中,应该理解到,所揭露的方法和平台,可以通过其它的方式实现。例如,以上所描述的系统实施方式仅仅是示意性的,例如,模块或单元的划分,仅仅为一种逻辑功能划分,实际实现时可以有另外的划分方式,例如单元或组件可以结合或者可以集成到另一个系统,或一些特征可以忽略,或不执行。另一点,所显示或讨论的相互之间的耦合或直接耦合或通信连接可以是通过一些接口,系统或单元的间接耦合或通信连接,可以是电性、机械或其它的形式。
178.另外,在本技术各个实施例中的各功能单元可以集成在一个处理单元中,也可以是各个单元单独物理存在,也可以两个或两个以上单元集成在一个单元中。上述集成的单
元既可以采用硬件的形式实现,也可以采用软件功能单元的形式实现。集成的单元如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解,本技术的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的全部或部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品存储在一个存储介质中,包括若干指令用以使得一台计算机设备(可以是个人计算机,服务器,或者网络设备等)或处理器(processor) 执行本技术各个实施方式方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括:u盘、移动硬盘、只读存储器(rom,read-only memory)、随机存取存储器(ram, random access memory)、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
179.若本技术技术方案涉及个人信息,应用本技术技术方案的产品在处理个人信息前,已明确告知个人信息处理规则,并取得个人自主同意。若本技术技术方案涉及敏感个人信息,应用本技术技术方案的产品在处理敏感个人信息前,已取得个人单独同意,并且同时满足“明示同意”的要求。例如,在摄像头等个人信息采集装置处,设置明确显著的标识告知已进入个人信息采集范围,将会对个人信息进行采集,若个人自愿进入采集范围即视为同意对其个人信息进行采集;或者在个人信息处理的装置上,利用明显的标识/信息告知个人信息处理规则的情况下,通过弹窗信息或请个人自行上传其个人信息等方式获得个人授权;其中,个人信息处理规则可包括个人信息处理者、个人信息处理目的、处理方式以及处理的个人信息种类等信息。

技术特征:
1.一种医学数据分析方法,其特征在于,包括:响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,所述目标队列包含若干目标对象,所述目标队列的医学数据包括所述若干目标对象的生物组学数据;对所述目标队列的医学数据进行分析,得到所述目标队列的医学数据分析结果;显示所述目标队列的医学数据分析结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述目标队列的医学数据进行分析,得到所述目标队列的医学数据分析结果,包括以下任意一个或多个步骤:响应于在数据分析界面上的第一触发操作,对所述目标队列中的所述医学数据进行统计,得到所述目标队列的队列数据统计情况;响应于在所述数据分析界面上的第二触发操作,将所述目标队列与参考队列的医学数据进行对比,得到所述目标队列的队列对比情况;响应于在所述数据分析界面上的第三触发操作,利用所述目标队列的医学数据进行基因统计,得到所述目标队列的基因图谱,所述基因图谱用于表征所述目标队列中的目标对象的基因突变情况;响应于在所述数据分析界面上的第四触发操作,利用所述目标队列的医学数据进行生存分析,得到所述目标队列的生存分析结果。3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,至少部分所述医学数据分析结果采用图表进行显示;和/或,所述医学数据还包括所述目标对象的临床数据,所述临床数据包括所述目标对象的基本信息和疾病信息,所述生物组学数据包括所述目标对象的基因信息和基因检测文件中的至少一种,所述基因检测文件包含对所述目标对象的样本进行基因检测得到基因检测结果。4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述队列数据统计情况包括第一队列情况、对所述临床数据统计得到的临床统计情况和对所述生物组学数据统计得到的生物组学统计情况;所述第一队列情况包括所述目标队列的名称、所述目标队列的对象数量中的至少一者;所述临床统计情况包括以下至少一者:所述目标队列中不同性别的比例、所述目标队列中不同患病年龄区间的比例、所述目标队列的生存曲线;所述生物组学统计情况包括若干第一预设基因的对象数量统计情况。5.根据权利要求2至4任一项所述的方法,其特征在于,不同的所述队列数据统计情况显示在队列情况显示界面的不同区域;所述方法还包括以下至少一个步骤:响应于对所述队列情况显示界面的标题编辑触发操作,将所述队列情况显示界面的第一标题调整为可编辑状态,并基于输入标题信息更新所述第一标题;响应于在所述队列情况显示界面上的更新触发操作,重新统计并显示所选择的所述队列数据统计情况;响应于在所述队列情况显示界面上的第一下载触发操作,下载所选择的所述队列数据统计情况;
获取在所述队列情况显示界面的第一搜索区输入的基因名称,从所述目标队列的医学数据中查找出与所述输入的基因名称的关联数据,并在所述队列情况显示界面显示所述关联数据。6.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述队列对比情况包括第二队列情况、对所述临床数据进行比对得到的临床对比情况和对所述生物组学数据比对得到的生物组学比对情况;所述第二队列情况包括所述目标队列和所述参考队列的名称、所述目标队列和所述参考队列的对象数量中的至少一者;所述临床对比情况包括以下至少一者:所述目标队列和所述参考队列中不同性别的对象数量差异、所述目标队列和所述参考队列中患病年龄的情况差异、所述目标队列和所述参考队列的生存曲线;所述生物组学对比情况包括以下至少一者:所述目标队列和所述参考队列的基因突变频率对比情况、所述目标队列和所述参考队列中突变频率大于预设阈值的突变基因的对比情况、若干第二预设基因在所述目标队列和所述参考队列中的突变频率对比情况、所述目标队列和所述参考队列中的各基因情况。7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述显示所述目标队列的医学数据分析结果,包括:在对比显示界面的第一区域显示所述第二队列情况;以及,响应于对所述对比显示界面的第一触发键的触发,在所述对比显示界面的第二区域显示所述临床对比情况,响应于对所述对比显示界面的第二触发键的触发,在所述对比显示界面的第二区域显示所述生物组学比对情况。8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:响应于在对比显示界面的标题编辑触发操作,将所述对比显示界面的第二标题调整为可编辑状态,并基于输入的标题信息更新所述第二标题;响应于在所述对比显示界面上的第二下载触发操作,下载所选择的所述队列对比情况;在所述对比显示界面的第二区域显示所述生物组学比对情况的情况下,响应于对所述第二区域的基因情况显示区的导出操作,导出所述基因情况显示区中所选择的基因情况,其中,所述基因情况显示区用于显示所述目标队列和参考队列中的各基因情况;在所述第二区域显示所述生物组学比对情况的情况下,获取在所述第二区域的第二搜索区输入的基因名称,从所述目标队列和/或参考队列的医学数据中查找出所述输入的基因名称的相关基因情况,并在所述基因情况显示区更新显示所述相关基因情况;在所述第二区域显示所述生物组学比对情况的情况下,响应于对所述第二区域的显著性展示项的选择操作,在所述基因情况显示区中只显示具有显著性效应的基因情况。9.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述基因图谱包括所述目标队列中各目标对象的突变基因数量情况和所述目标队列中各基因发生突变的对象数量情况。10.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述对所述目标队列的医学数据进行分析,得到所述目标队列的医学数据分析结果,还包括:响应于所述第三触发操作,统计得到所述目标队列的临床统计信息和组学类型统计信息,所述组学类型统计信息包括所述目
标队列中各目标对象的所述基因检测文件的类型。11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于,所述基因图谱采用热力图和柱形图的组合图表示,所述热力图用于表示所述目标队列中各基因发生突变的热度分布,所述柱形图包括第一柱形图和第二柱形图,所述第一柱形图用于表示所述目标队列中各目标对象的突变基因数量情况,所述第二柱形图用于表示所述目标队列中各基因发生突变的对象数量情况;和/或,所述基因图谱、临床统计信息和组学类型统计信息均采用图表进行表示,且显示在同一显示界面上。12.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述显示所述目标对象的医学数据分析结果,包括:在生存分析显示界面的不同区域显示所述目标队列的第三队列情况和所述生存分析结果,所述第三队列情况包括所述目标队列的总对象数量、所述目标队列中所选择的有效对象数量、所述有效对象数量在所述总对象数量中的占比;和/或,所述方法还包括以下至少一个步骤:响应于在生存分析显示界面上的结果导出操作,导出所述生存分析结果;根据输入的关键参数,从所述生存分析结果查找出与所述关键参数匹配的结果数据,并显示和/或导出所述结果数据。13.根据权利要求1至12任一项所述的方法,其特征在于,在所述响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据之前,所述方法还包括:检测到对数据管理平台的登录,显示所述数据管理平台的主界面;响应于在所述主界面的分析模块选择操作,显示所述数据管理平台的数据分析界面;所述分析触发操作是在所述数据分析界面进行的;所述获取目标队列的医学数据,包括:将输入至所述数据管理平台的数据,作为所述目标队列的医学数据,或者,将所选择的所述数据管理平台中的医学数据,作为所述目标队列的医学数据。14.一种数据管理平台,其特征在于,包括:响应触发子模块,用于响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,所述目标队列包含若干目标对象,所述目标队列的医学数据包括所述若干目标对象的生物组学数据;数据分析子模块,用于对所述目标队列的医学数据进行分析,得到所述目标队列的医学数据分析结果;结果显示子模块,用于显示所述目标队列的医学数据分析结果。15.一种电子设备,其特征在于,包括存储器和处理器,所述处理器用于执行所述存储器中存储的程序指令,以实现权利要求1至13任一项所述的方法。16.一种计算机可读存储介质,其上存储有程序指令,其特征在于,所述程序指令被处理器执行时实现权利要求1至13任一项所述的方法。

技术总结
本申请公开了一种医学数据分析方法和平台、设备、介质,医学数据分析方法包括:响应于分析触发操作,获取目标队列的医学数据,其中,目标队列包含若干目标对象,目标队列的医学数据包括若干目标对象的生物组学数据;对目标队列的医学数据进行分析,得到目标队列的医学数据分析结果;显示目标队列的医学数据分析结果。上述方案,能够方便用户了解目标队列内的医学数据情况。医学数据情况。医学数据情况。


技术研发人员:段琦 张少霆
受保护的技术使用者:上海商汤智能科技有限公司
技术研发日:2022.03.29
技术公布日:2022/7/5
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